More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3574 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 281 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  62.74 
 
 		 284 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  59.7 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  60.92 
 
 		 278 aa  332  3e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  59.7 
 
 		 278 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  57.69 
 
 		 289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  53.93 
 
 		 283 aa  309  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  54.55 
 
 		 323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  47.14 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  45.04 
 
 		 291 aa  208  6e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1136  arogenate dehydrogenase  39.15 
 
 		 291 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20101  arogenate dehydrogenase  39.53 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.624497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  42.25 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  38.55 
 
 		 288 aa  191  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  34.73 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  36.02 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  35.63 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  35.5 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  37.01 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  40.93 
 
 		 367 aa  175  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  35.66 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  39.54 
 
 		 375 aa  169  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  37.46 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  35.03 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  35.89 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  35.89 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  37.79 
 
 		 364 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  34.49 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  34.88 
 
 		 293 aa  161  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  34.88 
 
 		 293 aa  161  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  35.34 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  35.48 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  36.81 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  35.94 
 
 		 298 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  33.46 
 
 		 286 aa  157  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  32.98 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  33.69 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  36.18 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.28 
 
 		 298 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  31.25 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  33.57 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  36.92 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.39 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  34.83 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.8 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  33.81 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  32.28 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.8 
 
 		 746 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.1 
 
 		 311 aa  148  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.49 
 
 		 735 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  30.36 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  35.54 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  35.54 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 		 294 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  33.81 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.1 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  31.52 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  34.52 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  33.22 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  29.71 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  33.58 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  35.29 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  32.03 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  38.21 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.1 
 
 		 752 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.99 
 
 		 314 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  32.51 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  34.34 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  35.77 
 
 		 360 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  33.85 
 
 		 293 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  32.99 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  32.28 
 
 		 534 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  36.02 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  33.33 
 
 		 535 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  30.74 
 
 		 366 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  27.24 
 
 		 365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.39 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0928  prephenate dehydrogenase  34.27 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.45 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.12 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.36 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.21 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  30.58 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  35.61 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  32.03 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 		 364 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  35.98 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.98 
 
 		 313 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.75 
 
 		 746 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  33.57 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>