275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1136 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1136  arogenate dehydrogenase  100 
 
 
291 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20101  arogenate dehydrogenase  97.59 
 
 
291 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.624497  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  54.55 
 
 
314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  53.93 
 
 
308 aa  299  3e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  51.92 
 
 
288 aa  279  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  50.38 
 
 
291 aa  261  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  45.95 
 
 
279 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  45.56 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  45.56 
 
 
279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  43.08 
 
 
279 aa  253  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  45.59 
 
 
278 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  45.21 
 
 
278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  41.38 
 
 
284 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  41.51 
 
 
283 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  41.96 
 
 
289 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  41.02 
 
 
278 aa  203  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  39.69 
 
 
323 aa  192  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  39.15 
 
 
281 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  33.59 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 
364 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  29.6 
 
 
293 aa  123  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  29.6 
 
 
293 aa  123  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 
280 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  30.71 
 
 
297 aa  122  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  30 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  30.25 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  31.02 
 
 
282 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 
291 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  28.07 
 
 
319 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 
365 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 
301 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 
280 aa  119  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  27.64 
 
 
303 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.15 
 
 
746 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.15 
 
 
746 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36910  prephenate dehydrogenase  33.61 
 
 
322 aa  118  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 
367 aa  118  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  28.12 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  29.47 
 
 
534 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  32.49 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.25 
 
 
750 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.84 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.47 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  27.72 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.47 
 
 
746 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  32.31 
 
 
364 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  35.6 
 
 
360 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  27.21 
 
 
328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  30.92 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  30.4 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  32.1 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.72 
 
 
746 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  27.3 
 
 
535 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  26.5 
 
 
288 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  25.89 
 
 
288 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  27.18 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  27.49 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  29.53 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  25.8 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  26.74 
 
 
379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  30.43 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  28.18 
 
 
367 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  28.9 
 
 
375 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 
276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  29.33 
 
 
367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.35 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  25.62 
 
 
366 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.98 
 
 
746 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  25.17 
 
 
369 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.86 
 
 
735 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  26.84 
 
 
276 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 
366 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1638  Prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 
283 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  27.14 
 
 
366 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0106  Prephenate dehydrogenase  30.62 
 
 
290 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  32.16 
 
 
369 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 
366 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 
366 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  26.9 
 
 
293 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 
366 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 
378 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  25 
 
 
293 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 
366 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  24.74 
 
 
366 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.92 
 
 
752 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  27.82 
 
 
280 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  27.97 
 
 
286 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  37.58 
 
 
360 aa  106  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  30.81 
 
 
276 aa  106  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.11 
 
 
321 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.3 
 
 
312 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  25 
 
 
292 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  27.02 
 
 
285 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.76 
 
 
321 aa  105  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.86 
 
 
319 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.33 
 
 
746 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  27.82 
 
 
378 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.96 
 
 
301 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>