276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1535 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
369 aa  731    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  87.8 
 
 
369 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  61.75 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  54.25 
 
 
388 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  55.31 
 
 
370 aa  345  8.999999999999999e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  53.85 
 
 
369 aa  331  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  51.94 
 
 
369 aa  307  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  44.94 
 
 
361 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  41.94 
 
 
361 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  44.48 
 
 
363 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  43.75 
 
 
357 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  46.78 
 
 
357 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  41.37 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  42.05 
 
 
355 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  40 
 
 
370 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  40.44 
 
 
371 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  39.17 
 
 
396 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  36.62 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  41.16 
 
 
283 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  40.93 
 
 
292 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  36.01 
 
 
375 aa  146  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  29.01 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  34.09 
 
 
364 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  33.85 
 
 
360 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  33.85 
 
 
370 aa  124  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 
299 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  31.98 
 
 
367 aa  122  9e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  31.7 
 
 
286 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  24.52 
 
 
367 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  40 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.55 
 
 
746 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  31.29 
 
 
339 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  34.85 
 
 
294 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  34.85 
 
 
294 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.86 
 
 
301 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  33.47 
 
 
373 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  31.79 
 
 
356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  35.02 
 
 
301 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  35.02 
 
 
291 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.5 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.28 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  27.7 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  27.34 
 
 
280 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.29 
 
 
735 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  32.84 
 
 
278 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.16 
 
 
313 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.31 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.08 
 
 
746 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.9 
 
 
746 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  29.85 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  35.14 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  32.47 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.1 
 
 
311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.57 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  25.91 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.28 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.19 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.69 
 
 
746 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.69 
 
 
746 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.16 
 
 
752 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  28.99 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  24.5 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  27.66 
 
 
281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  34.6 
 
 
290 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  33.98 
 
 
323 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  24.93 
 
 
366 aa  109  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  32.02 
 
 
291 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.5 
 
 
313 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.89 
 
 
311 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  30.28 
 
 
297 aa  109  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.43 
 
 
311 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.51 
 
 
746 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  33.72 
 
 
319 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.1 
 
 
308 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  32.3 
 
 
292 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  37.4 
 
 
348 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  33.58 
 
 
322 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.98 
 
 
314 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.91 
 
 
312 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  32.68 
 
 
313 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  31.89 
 
 
280 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  30.49 
 
 
360 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  32.77 
 
 
292 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  33.46 
 
 
534 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.5 
 
 
311 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  32.94 
 
 
286 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.02 
 
 
750 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  32.1 
 
 
297 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  32.03 
 
 
309 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 
298 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  31.48 
 
 
285 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  31.96 
 
 
294 aa  106  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.14 
 
 
746 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  27.2 
 
 
363 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 
328 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>