268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2998 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 357 aa  684    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  73.94 
 
 		 363 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  64.14 
 
 		 357 aa  354  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  58.71 
 
 		 355 aa  342  5e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  57.26 
 
 		 387 aa  329  6e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  51.82 
 
 		 361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  50.69 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  49.3 
 
 		 371 aa  280  3e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  51.97 
 
 		 370 aa  279  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  45.33 
 
 		 369 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  43.75 
 
 		 369 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  47.63 
 
 		 369 aa  258  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  47.14 
 
 		 361 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  44.03 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  55.2 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  49.23 
 
 		 369 aa  236  6e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  43.75 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  51.44 
 
 		 283 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  40.98 
 
 		 386 aa  223  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  44.41 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  32.34 
 
 		 379 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  38.28 
 
 		 301 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  38.28 
 
 		 291 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  35.01 
 
 		 373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.27 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.83 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.27 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 		 367 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.65 
 
 		 312 aa  126  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.58 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  33.09 
 
 		 390 aa  123  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.31 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  33.94 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  28.46 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.68 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  35.77 
 
 		 319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.2 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  37.6 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  28.08 
 
 		 367 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  37.97 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.98 
 
 		 746 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  34.71 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.82 
 
 		 308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  25.32 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  34.14 
 
 		 312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  25.26 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.16 
 
 		 770 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  34.97 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  27.2 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  34.71 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.71 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  34.9 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.68 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  35.07 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  27.49 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  33.59 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  33.79 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  27.79 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  35.97 
 
 		 288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  27.97 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  35.14 
 
 		 328 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  27.79 
 
 		 378 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  27.97 
 
 		 366 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.08 
 
 		 311 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  32.22 
 
 		 293 aa  109  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  27.68 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  27.68 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  34.73 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  30.97 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  27.68 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  33.85 
 
 		 288 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  27.22 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  27.51 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  30.51 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  36.78 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  30.65 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0968  Prephenate dehydrogenase  39.59 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.07 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.07 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  35.71 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  35.8 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.19 
 
 		 735 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  34.96 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.52 
 
 		 746 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  34.72 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  32.68 
 
 		 287 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  34.59 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  34.27 
 
 		 291 aa  106  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  32.92 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  35.62 
 
 		 292 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  32.7 
 
 		 360 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  34.69 
 
 		 289 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  32.84 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  29.46 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.96 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  35.47 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  33.86 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  33.86 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>