268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1175 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 369 aa  704    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  49.45 
 
 		 361 aa  295  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  48.92 
 
 		 357 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  44.44 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  47.37 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  47.09 
 
 		 355 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  42.78 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  46.15 
 
 		 357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  40 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  42.68 
 
 		 371 aa  192  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  49.48 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  39.07 
 
 		 388 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  43.83 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  43.46 
 
 		 283 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  36.52 
 
 		 369 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  35.1 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 		 396 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  38.48 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  31.23 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  37.35 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  39.76 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  31.66 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  35.55 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  33.83 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  38.52 
 
 		 285 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  27.22 
 
 		 366 aa  125  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  26.56 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  37.4 
 
 		 291 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  30.6 
 
 		 270 aa  123  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  33.71 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  30.34 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 		 364 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  33.46 
 
 		 297 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.82 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.93 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.12 
 
 		 307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  36.33 
 
 		 313 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  32.08 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.35 
 
 		 742 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.48 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.48 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  35.64 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.29 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  32.25 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 		 288 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  38.1 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  34.02 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  34.48 
 
 		 290 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 288 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  36.54 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  33.73 
 
 		 294 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  34.89 
 
 		 360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.82 
 
 		 311 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  35.23 
 
 		 293 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  34.2 
 
 		 367 aa  113  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  35.15 
 
 		 370 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  36.33 
 
 		 292 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  35.41 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.27 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.94 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.94 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  31.93 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  35.91 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  32.65 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.78 
 
 		 748 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 		 290 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.2 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  35.12 
 
 		 293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  29.2 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  30.17 
 
 		 320 aa  110  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.22 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  34.24 
 
 		 309 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.68 
 
 		 770 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  39.02 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  33.77 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.03 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  32.33 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.98 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  32.33 
 
 		 312 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.73 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.74 
 
 		 750 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.5 
 
 		 746 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  33.98 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  34.5 
 
 		 301 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  28.4 
 
 		 366 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  36.25 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.58 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  38.39 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.72 
 
 		 735 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.66 
 
 		 312 aa  106  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  28.08 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  28.4 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  28.4 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  27.3 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>