270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1535 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  87.8 
 
 		 369 aa  640    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 369 aa  724    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  63.49 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  55.74 
 
 		 388 aa  359  5e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  56.39 
 
 		 370 aa  352  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  54.25 
 
 		 369 aa  326  3e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  52.63 
 
 		 369 aa  311  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  45.74 
 
 		 363 aa  271  9e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  45.22 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  42.3 
 
 		 361 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  45.33 
 
 		 357 aa  259  6e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  41.42 
 
 		 387 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  45.95 
 
 		 357 aa  245  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  42.86 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  40.93 
 
 		 371 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  39.6 
 
 		 370 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  40.45 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  38.12 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  41.16 
 
 		 283 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  39.15 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  28.93 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  36.89 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  34.66 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  33.44 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  34.46 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  30.85 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  32.95 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  31.69 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  34.4 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.28 
 
 		 307 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32.3 
 
 		 293 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32.3 
 
 		 293 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  30.41 
 
 		 367 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  25.69 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  25.18 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.5 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  35.86 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  23.88 
 
 		 369 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  35.86 
 
 		 301 aa  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.71 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  33.23 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.58 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.13 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  39.27 
 
 		 285 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.74 
 
 		 321 aa  110  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.62 
 
 		 314 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.1 
 
 		 308 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  28.63 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  28.68 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  38.6 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  35.27 
 
 		 289 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  30.54 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.72 
 
 		 735 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.23 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.16 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  31.95 
 
 		 297 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  32.21 
 
 		 278 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  26.27 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  27.94 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.07 
 
 		 301 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.85 
 
 		 746 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.24 
 
 		 746 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  23.58 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 		 281 aa  106  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.24 
 
 		 746 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.75 
 
 		 313 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  31.84 
 
 		 278 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  32.18 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  23.81 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  27.81 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  27.81 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.57 
 
 		 746 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  23.81 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.01 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.95 
 
 		 746 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  23.21 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  28.46 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  23.51 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  32.57 
 
 		 534 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  31.23 
 
 		 286 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  24.92 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.5 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  32.82 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  23.51 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  23.51 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.43 
 
 		 746 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  31.13 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  31.15 
 
 		 280 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.03 
 
 		 750 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  23.51 
 
 		 378 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  23.51 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  23.51 
 
 		 378 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.1 
 
 		 313 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  32.41 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.05 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.47 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  34 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.89 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>