296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1803 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 373 aa  742    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  42.62 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  40.77 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  37.43 
 
 		 367 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  42.77 
 
 		 364 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  40.06 
 
 		 367 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  42.27 
 
 		 375 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  36.14 
 
 		 369 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  40.24 
 
 		 334 aa  223  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  35.23 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  35.5 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  35.23 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  34.96 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  34.96 
 
 		 378 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  39.62 
 
 		 370 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  34.96 
 
 		 366 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  35.23 
 
 		 366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  33.43 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  33.43 
 
 		 363 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  35.05 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  34.5 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  32.25 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  32.7 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  38.33 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  34.75 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1908  prephenate dehydrogenase  34.29 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  38.73 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  38.73 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  38.97 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  38.73 
 
 		 287 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  36.59 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  40.7 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  35.89 
 
 		 286 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  41.87 
 
 		 286 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.65 
 
 		 313 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.93 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.22 
 
 		 742 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  36.68 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  38.04 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  40.85 
 
 		 314 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  41.03 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  37.54 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.3 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  36.24 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.32 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.3 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  34.84 
 
 		 286 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  36.59 
 
 		 288 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.95 
 
 		 313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  40.77 
 
 		 322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  34.84 
 
 		 286 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  39.02 
 
 		 748 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  39.45 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.87 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.01 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.95 
 
 		 314 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.97 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  38.33 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.62 
 
 		 321 aa  172  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  36.14 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  38.14 
 
 		 330 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  40.14 
 
 		 295 aa  169  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  39.16 
 
 		 292 aa  168  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.1 
 
 		 313 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.76 
 
 		 311 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  36.18 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  36.81 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.89 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  36.99 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  39.31 
 
 		 285 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  37.15 
 
 		 293 aa  166  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.24 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.11 
 
 		 745 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.54 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  33.97 
 
 		 280 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  37.07 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  33.22 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  36.27 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  37.93 
 
 		 298 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.82 
 
 		 312 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.62 
 
 		 780 aa  160  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  38.02 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  38.03 
 
 		 312 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.49 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  37.06 
 
 		 294 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  35.07 
 
 		 320 aa  158  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 		 312 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  37.68 
 
 		 312 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.11 
 
 		 778 aa  157  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  36.36 
 
 		 289 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  37.02 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  36.99 
 
 		 302 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  36.93 
 
 		 309 aa  156  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.74 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  34.36 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  39.16 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  36.8 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>