269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_14060 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 386 aa  736    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  63.86 
 
 		 369 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  61.75 
 
 		 369 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  51.21 
 
 		 388 aa  317  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  52.41 
 
 		 369 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  50.67 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  47.45 
 
 		 369 aa  280  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  43.25 
 
 		 361 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  39.02 
 
 		 361 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  40.66 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  41.8 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  40.2 
 
 		 387 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  41.55 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  42.23 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  40.44 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  40.79 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  39.36 
 
 		 396 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  37.35 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.4 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  35.84 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  36.82 
 
 		 292 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  31.08 
 
 		 299 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  37.05 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  31.86 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  34.3 
 
 		 364 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  26.84 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  25.98 
 
 		 280 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  29.17 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  31.84 
 
 		 367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  27.55 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 379 aa  109  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  30.21 
 
 		 360 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  37.78 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.07 
 
 		 750 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  25.19 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  32.3 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  33.09 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  34.16 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  32.94 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  25.14 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  30.85 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  25.77 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  35.66 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  32.18 
 
 		 373 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  29.31 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  31.58 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  29.45 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  32.43 
 
 		 289 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  28.88 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.74 
 
 		 746 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 297 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  24.8 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 		 297 aa  99.8  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.06 
 
 		 746 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  27.18 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.39 
 
 		 746 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  30.17 
 
 		 280 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 278 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.33 
 
 		 735 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  37.93 
 
 		 323 aa  97.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  25.2 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  36.07 
 
 		 313 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 		 319 aa  96.7  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  25.21 
 
 		 366 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  33.82 
 
 		 292 aa  95.9  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.74 
 
 		 770 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  29.58 
 
 		 300 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.83 
 
 		 311 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.83 
 
 		 311 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.57 
 
 		 746 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0337  Prephenate dehydrogenase  35.16 
 
 		 295 aa  94  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139074 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  34.65 
 
 		 288 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.07 
 
 		 313 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.27 
 
 		 301 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  31.53 
 
 		 323 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  25.68 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  28.67 
 
 		 285 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.51 
 
 		 752 aa  92.8  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.62 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5343  prephenate dehydrogenase  31.51 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  26.22 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  25.21 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.21 
 
 		 746 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.52 
 
 		 314 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 283 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  26.43 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5050  prephenate dehydrogenase  31.51 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546878  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  24.8 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2051  Prephenate dehydrogenase  26.05 
 
 		 301 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.129678  decreased coverage  0.0000000000498492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.4 
 
 		 313 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1638  Prephenate dehydrogenase  34.22 
 
 		 283 aa  90.5  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 		 294 aa  90.5  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  24.93 
 
 		 378 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.16 
 
 		 311 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  33.11 
 
 		 276 aa  90.1  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  24.93 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>