296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3118 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 370 aa  679    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  56.39 
 
 		 369 aa  363  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  55.31 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  62.88 
 
 		 369 aa  345  8.999999999999999e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  56.92 
 
 		 388 aa  345  8.999999999999999e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  55.03 
 
 		 369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  50.67 
 
 		 386 aa  292  5e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  51.4 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  51.68 
 
 		 363 aa  276  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  48.18 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  46.33 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  47.8 
 
 		 387 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  47.59 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  44.38 
 
 		 355 aa  215  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  44.32 
 
 		 371 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  42.98 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  41.41 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  40 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  42.61 
 
 		 283 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  44.14 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  35.47 
 
 		 375 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  34.87 
 
 		 356 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 		 280 aa  130  4.0000000000000003e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  28.4 
 
 		 366 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  30.21 
 
 		 364 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  28.61 
 
 		 378 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  28.61 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  28.61 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  28.61 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  27.62 
 
 		 369 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  29.2 
 
 		 366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  26.51 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  24.33 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  28.61 
 
 		 366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  27.41 
 
 		 366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  42.86 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  32.82 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  26.95 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  32.24 
 
 		 370 aa  110  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  27.51 
 
 		 368 aa  110  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  31.1 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  30.13 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  34.86 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  24.56 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  24.56 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  36.29 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  27.56 
 
 		 270 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  34.83 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  34.98 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  33.84 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  23.77 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  34.48 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  31.72 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  26.27 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  22.4 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  27.65 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  29.97 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 		 360 aa  99.8  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  35.29 
 
 		 301 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  25.48 
 
 		 291 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  30.31 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.83 
 
 		 746 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  31.73 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  35.29 
 
 		 291 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.51 
 
 		 735 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  38.89 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  34.5 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.12 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 285 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  33.83 
 
 		 293 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  31.8 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.23 
 
 		 311 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  29.14 
 
 		 303 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 		 322 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 		 289 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5343  prephenate dehydrogenase  33.55 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  33.59 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5050  prephenate dehydrogenase  33.55 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4962  prephenate dehydrogenase  33.44 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308401  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  31.72 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2572  prephenate dehydrogenase  26.69 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474383  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1638  Prephenate dehydrogenase  36.21 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4050  Prephenate dehydrogenase  38.92 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  29.69 
 
 		 280 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  28.98 
 
 		 334 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  31.15 
 
 		 292 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  33.96 
 
 		 535 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.21 
 
 		 301 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  33.65 
 
 		 281 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  32.66 
 
 		 284 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.8 
 
 		 313 aa  93.2  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  32.04 
 
 		 286 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  29.92 
 
 		 390 aa  92.8  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  34.49 
 
 		 292 aa  92.8  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  32.82 
 
 		 313 aa  92.8  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>