293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1455 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
363 aa  748    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
363 aa  748    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  65.37 
 
 
362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  47.25 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  45.25 
 
 
367 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  41.64 
 
 
369 aa  298  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  41.24 
 
 
378 aa  293  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  41.53 
 
 
366 aa  293  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  41.53 
 
 
378 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  41.53 
 
 
366 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  40.68 
 
 
366 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  41.53 
 
 
366 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  41.24 
 
 
366 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  41.41 
 
 
366 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  41.41 
 
 
366 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  38.9 
 
 
368 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  38.1 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  37.18 
 
 
364 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1908  prephenate dehydrogenase  38.62 
 
 
354 aa  230  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  32.21 
 
 
367 aa  215  9e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  33.43 
 
 
373 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  33.02 
 
 
375 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  31.52 
 
 
364 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  37.14 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  34.91 
 
 
365 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  30.57 
 
 
370 aa  189  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  34.14 
 
 
334 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  35.74 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.6 
 
 
313 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  34.51 
 
 
286 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  32.38 
 
 
288 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  34.89 
 
 
287 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  33 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1163  prephenate dehydrogenase  36.59 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  33.09 
 
 
290 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.69 
 
 
314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
369 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  32.34 
 
 
379 aa  172  9e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  36.96 
 
 
286 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.1 
 
 
314 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  33.81 
 
 
286 aa  170  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 
286 aa  170  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.22 
 
 
313 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.99 
 
 
298 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.77 
 
 
313 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  33.57 
 
 
313 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.45 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 
286 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.13 
 
 
742 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.92 
 
 
312 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.27 
 
 
307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  32.61 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  32.13 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  33.57 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.45 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.1 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  31.74 
 
 
328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.54 
 
 
313 aa  162  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.33 
 
 
750 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  31.04 
 
 
390 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  33.54 
 
 
360 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  33.81 
 
 
280 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.08 
 
 
311 aa  159  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.85 
 
 
308 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.05 
 
 
748 aa  159  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  34.15 
 
 
293 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  38.06 
 
 
280 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  34.72 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  34.72 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 
312 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  34.28 
 
 
292 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 
307 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.18 
 
 
310 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.03 
 
 
319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  31.79 
 
 
291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.9 
 
 
311 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.43 
 
 
311 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  35.09 
 
 
280 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  31.67 
 
 
313 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  29.54 
 
 
309 aa  152  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.14 
 
 
311 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 
301 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  30.61 
 
 
328 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  31.36 
 
 
295 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.26 
 
 
746 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  31.16 
 
 
320 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.82 
 
 
301 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.69 
 
 
312 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.43 
 
 
311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  31.51 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.43 
 
 
311 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.38 
 
 
746 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 
312 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 
312 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 
285 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 
289 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.62 
 
 
745 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 
534 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>