268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1208 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 355 aa  685    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  67.66 
 
 		 387 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  64.04 
 
 		 357 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  58.99 
 
 		 363 aa  353  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  58.71 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  48.76 
 
 		 361 aa  302  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  46.2 
 
 		 371 aa  253  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  46.5 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  43.18 
 
 		 369 aa  246  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  43.34 
 
 		 369 aa  242  7e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  41.53 
 
 		 370 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  52.33 
 
 		 283 aa  235  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  56.57 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  44.2 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  43.91 
 
 		 361 aa  229  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  47.4 
 
 		 369 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  42.09 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  44.38 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  41.14 
 
 		 386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  42.18 
 
 		 369 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  34.43 
 
 		 373 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  33.97 
 
 		 367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  32.34 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  37.05 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  34.41 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.65 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.65 
 
 		 321 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  30.49 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  27.34 
 
 		 280 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.01 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.87 
 
 		 307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.17 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.6 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.23 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.72 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  36.56 
 
 		 288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  27.38 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  36.13 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 		 367 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  33.15 
 
 		 370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  27.86 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  31.97 
 
 		 334 aa  126  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  27.86 
 
 		 369 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  36.3 
 
 		 289 aa  125  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  33.79 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.57 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.17 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  31.9 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.43 
 
 		 780 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  27.58 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  27.86 
 
 		 366 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  34.59 
 
 		 301 aa  123  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  27.3 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  34.59 
 
 		 291 aa  123  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  27.58 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  36.68 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  27.58 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  27.58 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  32.62 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  25.27 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.66 
 
 		 746 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.66 
 
 		 746 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.66 
 
 		 735 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  27.58 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.4 
 
 		 770 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  36.32 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  36.46 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  27.3 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  35.27 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  35.31 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  26.52 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  35.68 
 
 		 308 aa  119  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  35.63 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  36.86 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.15 
 
 		 778 aa  119  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  31.85 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  27.08 
 
 		 280 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  35.19 
 
 		 285 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.94 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  33.88 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  34.92 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  34.92 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  35.59 
 
 		 292 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  35.27 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  33.92 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  35.27 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.97 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  35.27 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  34.89 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  32.17 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  37.19 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.47 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  31.83 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  34.4 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  30.07 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  34.38 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.29 
 
 		 314 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  30.11 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  31.64 
 
 		 313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>