288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1235 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
371 aa  720    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  49.02 
 
 
357 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  48.61 
 
 
363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  43.77 
 
 
361 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  46.2 
 
 
355 aa  259  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  43.23 
 
 
387 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  43.7 
 
 
361 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  45.48 
 
 
369 aa  246  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  49.44 
 
 
357 aa  246  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  41.55 
 
 
369 aa  245  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  40.44 
 
 
369 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  42.36 
 
 
388 aa  232  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  41.5 
 
 
370 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  41.55 
 
 
386 aa  228  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  44.11 
 
 
370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  40.83 
 
 
369 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  40.92 
 
 
396 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  41.77 
 
 
369 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  44.29 
 
 
283 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  43.29 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  28.07 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  30.92 
 
 
280 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  36.64 
 
 
367 aa  140  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  27.37 
 
 
367 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  34.36 
 
 
299 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  35.76 
 
 
373 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  38.78 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  35.63 
 
 
288 aa  137  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  37.74 
 
 
308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  37.36 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  37.36 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  29.39 
 
 
280 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  37.6 
 
 
292 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  39.21 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  37.74 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  33.14 
 
 
390 aa  132  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  28.7 
 
 
366 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  30.98 
 
 
270 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  27.73 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  27.81 
 
 
366 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  38.75 
 
 
286 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  35.63 
 
 
301 aa  130  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.46 
 
 
742 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  27.81 
 
 
366 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  35.12 
 
 
364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  27.06 
 
 
378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  26.93 
 
 
366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  28.4 
 
 
366 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  28.11 
 
 
378 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  36.73 
 
 
292 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  26.74 
 
 
366 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  26.67 
 
 
366 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  28.85 
 
 
364 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  35.71 
 
 
293 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  35.71 
 
 
293 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  37.4 
 
 
302 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  36.6 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  33.94 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  36.08 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  34.75 
 
 
294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  37.21 
 
 
298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.45 
 
 
748 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  29.39 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  36.5 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  26.67 
 
 
366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.5 
 
 
770 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  35 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  36.96 
 
 
302 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  29.91 
 
 
379 aa  126  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  27.38 
 
 
365 aa  126  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.21 
 
 
307 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  36.95 
 
 
294 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  33.56 
 
 
293 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  35.23 
 
 
322 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  36.95 
 
 
294 aa  125  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  35.2 
 
 
300 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 
289 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  37 
 
 
298 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  32.99 
 
 
286 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.94 
 
 
750 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  36.6 
 
 
329 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  36.88 
 
 
295 aa  123  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  35.74 
 
 
292 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  33.53 
 
 
370 aa  123  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  36.92 
 
 
334 aa  122  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.39 
 
 
780 aa  122  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
288 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.11 
 
 
778 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.47 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  34.51 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  36.09 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  34.3 
 
 
290 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0949  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.78 
 
 
749 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0199  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.78 
 
 
749 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  33.77 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  37.69 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2574  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.78 
 
 
749 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.47 
 
 
311 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.47 
 
 
311 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  33.99 
 
 
286 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>