269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15320 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 369 aa  704    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  52.63 
 
 		 369 aa  335  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  51.94 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  54.47 
 
 		 369 aa  324  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  51.77 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  55.03 
 
 		 370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  47.18 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  44.54 
 
 		 361 aa  265  5.999999999999999e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  43.65 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  45.4 
 
 		 363 aa  236  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  43.85 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  43.44 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  42.18 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  40.83 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  44.03 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  38.55 
 
 		 370 aa  180  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  41.23 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  38.19 
 
 		 396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.45 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  38.03 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  30.65 
 
 		 280 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  34.51 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  36.25 
 
 		 375 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  35.61 
 
 		 356 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  32.68 
 
 		 282 aa  126  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  37.87 
 
 		 298 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  29.46 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  25.07 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  27.47 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  31.25 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 		 379 aa  120  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  32.93 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  35.47 
 
 		 300 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  32.8 
 
 		 364 aa  120  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  35.71 
 
 		 301 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  35.71 
 
 		 291 aa  119  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  34.33 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  36.4 
 
 		 290 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  30.31 
 
 		 280 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  34.33 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  33.93 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  33.98 
 
 		 292 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  38.26 
 
 		 285 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  28.3 
 
 		 281 aa  115  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  35.29 
 
 		 292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  34.51 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  32.15 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.96 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  34.66 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  30.49 
 
 		 270 aa  114  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  36.55 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  39.58 
 
 		 285 aa  113  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  35.29 
 
 		 292 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.58 
 
 		 735 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  31.18 
 
 		 319 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 		 360 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  35.53 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  37.2 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  34.34 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.81 
 
 		 752 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  35.29 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2051  Prephenate dehydrogenase  27.2 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.129678  decreased coverage  0.0000000000498492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  27.62 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  27.33 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  27.03 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  27.49 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  34.36 
 
 		 307 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  35.36 
 
 		 293 aa  110  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  34.46 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  34.9 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  27.33 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  26.61 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  37.44 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  27.33 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.07 
 
 		 746 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  28.66 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.36 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  27.03 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  27.03 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.4 
 
 		 770 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  34.66 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  30.89 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.96 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  25.87 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  27.03 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.96 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.91 
 
 		 780 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  34.6 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  34.26 
 
 		 301 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.58 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  33.72 
 
 		 534 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 303 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.67 
 
 		 742 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.7 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.96 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  26.88 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.21 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  34.33 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>