284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1040 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 370 aa  718    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  58.89 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  55.59 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  45.8 
 
 		 367 aa  262  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  44.51 
 
 		 375 aa  247  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  38.74 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  43.29 
 
 		 364 aa  229  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  34.64 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  39.62 
 
 		 373 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  38.18 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  35.88 
 
 		 369 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  32.4 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  35.51 
 
 		 366 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  35.8 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  35.8 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  34.71 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  35.8 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  35.51 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  35.23 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  34.94 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  34.94 
 
 		 366 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  30.64 
 
 		 365 aa  189  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  30.57 
 
 		 363 aa  189  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  30.57 
 
 		 363 aa  189  9e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  30.03 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  39.58 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  40.85 
 
 		 293 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  30.9 
 
 		 362 aa  180  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  40.14 
 
 		 288 aa  179  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  39.25 
 
 		 742 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  41.38 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  41 
 
 		 318 aa  176  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  39.07 
 
 		 288 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  39.93 
 
 		 290 aa  172  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  39.22 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  39 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.85 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  38.73 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.87 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.69 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  38.02 
 
 		 320 aa  167  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.27 
 
 		 746 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  39.39 
 
 		 330 aa  166  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.81 
 
 		 746 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  41.63 
 
 		 291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  37.89 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  41.34 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.46 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  32.7 
 
 		 379 aa  164  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.7 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  39.06 
 
 		 293 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  39.06 
 
 		 293 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  37.74 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.68 
 
 		 307 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  36.93 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  35.66 
 
 		 289 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  36.64 
 
 		 286 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.49 
 
 		 750 aa  161  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  31.42 
 
 		 280 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.79 
 
 		 746 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.18 
 
 		 748 aa  160  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  36.27 
 
 		 286 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  37.01 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.08 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.08 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.92 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  37.98 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.87 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  39.93 
 
 		 295 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.48 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  39.62 
 
 		 746 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  36.64 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  39.33 
 
 		 298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.33 
 
 		 746 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  30.08 
 
 		 368 aa  155  8e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  37.68 
 
 		 534 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.16 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  40 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  34.54 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  39.23 
 
 		 746 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.26 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  39.23 
 
 		 746 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.45 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.02 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  39.06 
 
 		 286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  38.7 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.6 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.01 
 
 		 752 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 		 290 aa  153  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.4 
 
 		 310 aa  152  7e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  35.79 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  37.8 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.14 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.27 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  38.76 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.75 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  36.29 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  38.82 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>