More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3737 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
356 aa  692    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  34.16 
 
 
364 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  38.12 
 
 
367 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  36.36 
 
 
375 aa  185  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  28.53 
 
 
366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  37.29 
 
 
364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  39.58 
 
 
319 aa  176  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  40.89 
 
 
360 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  32.5 
 
 
280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  36.46 
 
 
339 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  30.45 
 
 
367 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  36.64 
 
 
370 aa  169  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  38.35 
 
 
286 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  35.55 
 
 
360 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  38.62 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  38.16 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  38.49 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  34.93 
 
 
299 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  31.63 
 
 
334 aa  164  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  37.46 
 
 
286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  37.23 
 
 
287 aa  162  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  39.36 
 
 
290 aa  162  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  32.68 
 
 
280 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  30.03 
 
 
366 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  29.75 
 
 
366 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  36.04 
 
 
286 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  29.75 
 
 
366 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  29.75 
 
 
378 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  36.4 
 
 
286 aa  159  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  29.75 
 
 
366 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.6 
 
 
748 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  29.48 
 
 
378 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  29.48 
 
 
366 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  30.36 
 
 
369 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.26 
 
 
742 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  29.78 
 
 
366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  29.75 
 
 
366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  36.56 
 
 
288 aa  156  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  41.72 
 
 
288 aa  155  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  32.98 
 
 
286 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  39.04 
 
 
322 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  39.18 
 
 
292 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 
368 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  30.94 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.62 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 
293 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 
293 aa  153  4e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  37.89 
 
 
293 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  40.33 
 
 
300 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  37.99 
 
 
288 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  35.23 
 
 
290 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  38.22 
 
 
286 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  30.03 
 
 
367 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  36.79 
 
 
289 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.19 
 
 
735 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.66 
 
 
307 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.89 
 
 
746 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  39.1 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.19 
 
 
746 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  35.19 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  34.55 
 
 
292 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  35.45 
 
 
293 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  34.55 
 
 
292 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.54 
 
 
746 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.75 
 
 
301 aa  146  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  26.33 
 
 
363 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  26.33 
 
 
363 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.19 
 
 
746 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  30.52 
 
 
373 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  29.09 
 
 
270 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.54 
 
 
752 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  26.05 
 
 
362 aa  144  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  36.5 
 
 
294 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.82 
 
 
770 aa  143  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  36.5 
 
 
294 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  34.86 
 
 
297 aa  142  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  25.54 
 
 
369 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.86 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 
308 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.15 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  30.22 
 
 
279 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.86 
 
 
311 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.8 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.8 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1832  Prephenate dehydrogenase  38.52 
 
 
302 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  36.95 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  35.61 
 
 
292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.31 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.84 
 
 
746 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.74 
 
 
310 aa  139  7.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  38.52 
 
 
298 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  38.28 
 
 
302 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  38.81 
 
 
334 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  36.5 
 
 
535 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  37.32 
 
 
295 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  30.05 
 
 
379 aa  138  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  38.4 
 
 
292 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  34.63 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  37.08 
 
 
534 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>