269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6984 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  50.52 
 
 		 387 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  48.23 
 
 		 361 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  51.97 
 
 		 355 aa  221  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  52.72 
 
 		 357 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  51.99 
 
 		 363 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  52.71 
 
 		 357 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  47.86 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  44.29 
 
 		 371 aa  193  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  43.46 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  42.96 
 
 		 361 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  41.16 
 
 		 369 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  41.16 
 
 		 369 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  41.03 
 
 		 369 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  42.61 
 
 		 370 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  39.42 
 
 		 370 aa  158  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  45.06 
 
 		 388 aa  158  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  41.18 
 
 		 396 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.88 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.54 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.54 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  38.03 
 
 		 369 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  29.55 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  34.77 
 
 		 319 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  35.84 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  36.43 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  35.84 
 
 		 386 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  34.43 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.88 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.71 
 
 		 298 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  29.32 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  40.93 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  32.87 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  36.04 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  37.2 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2431  Prephenate dehydrogenase  32.74 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  31.44 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  38.14 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  38.14 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 		 290 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  34.94 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  35.96 
 
 		 317 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  36.72 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  33.68 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  36.11 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  33.8 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  35.34 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  30.38 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  39.8 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.27 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  32.87 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.97 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  36.65 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  33.92 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  35.11 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  34.85 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  34.85 
 
 		 329 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  33.84 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  35.71 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 		 367 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 		 369 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  28.02 
 
 		 270 aa  115  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  34.13 
 
 		 312 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  34.74 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  32.3 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  28.9 
 
 		 366 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  35.63 
 
 		 291 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 		 366 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  30.14 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.59 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  33.56 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  32.08 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  32.08 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.1 
 
 		 742 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  34.6 
 
 		 322 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 		 366 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.18 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  34.03 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.61 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.62 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  36.47 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  34.48 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  30.19 
 
 		 367 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  33.71 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  37.91 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  32.08 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  35.14 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  32.89 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.76 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  34.13 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  32.99 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>