265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2462 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 361 aa  699    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  51.53 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  51.22 
 
 		 387 aa  308  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  51.82 
 
 		 357 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  49.02 
 
 		 361 aa  288  7e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  51.15 
 
 		 357 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  48.76 
 
 		 355 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  51.99 
 
 		 369 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  47.35 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  41.94 
 
 		 369 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  42.3 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  45.75 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  46.33 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  43.77 
 
 		 371 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15320  prephenate dehydrogenase  42.54 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.218045  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14060  prephenate dehydrogenase  38.44 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.75481  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  39.61 
 
 		 370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  48.23 
 
 		 283 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2453  prephenate dehydrogenase  48.78 
 
 		 292 aa  196  6e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.513955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5060  prephenate dehydrogenase  38.95 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01744  normal  0.042313 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  30.19 
 
 		 379 aa  142  8e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  35.15 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  33.96 
 
 		 367 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  30 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  31.14 
 
 		 280 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  37.64 
 
 		 319 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  25.68 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  33.43 
 
 		 375 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  37.21 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  37.21 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.78 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  28.74 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  33.43 
 
 		 373 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  37.96 
 
 		 290 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.24 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.24 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.87 
 
 		 298 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.02 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  37.6 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  33.51 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  26.11 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  31.02 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.77 
 
 		 307 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  38.26 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  29.34 
 
 		 281 aa  122  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  35.92 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  34.84 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  38.52 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  25.52 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  33.07 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  37.74 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  37.08 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  32.41 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  38.87 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  34.92 
 
 		 297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.35 
 
 		 746 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  34.34 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  25.52 
 
 		 378 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  25.52 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  35.11 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  30.56 
 
 		 367 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.05 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.77 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  34.56 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.63 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  25.96 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2051  Prephenate dehydrogenase  30.26 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.129678  decreased coverage  0.0000000000498492 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.46 
 
 		 310 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.85 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  36.69 
 
 		 288 aa  116  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.85 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  25.66 
 
 		 366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  24.93 
 
 		 366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  25.66 
 
 		 366 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  25.66 
 
 		 378 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  25.22 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.24 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  25.16 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  35.75 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  35.02 
 
 		 308 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  37.07 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.58 
 
 		 313 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.36 
 
 		 748 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  33.57 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  32.66 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  38.54 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  38.54 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  33.22 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  34.77 
 
 		 293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  28.51 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  32.65 
 
 		 286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 		 311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.43 
 
 		 746 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  34.32 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  36.29 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>