280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2051 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2051  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
301 aa  618  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.129678  decreased coverage  0.0000000000498492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  31.79 
 
 
367 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  34.85 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  34.84 
 
 
366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  34.85 
 
 
378 aa  162  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  32.78 
 
 
369 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  33.99 
 
 
366 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  31.48 
 
 
367 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  33.99 
 
 
378 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  33.99 
 
 
366 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  33.82 
 
 
280 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  33 
 
 
366 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  34.64 
 
 
366 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
366 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  30.38 
 
 
299 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  30.13 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  34.8 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  29.77 
 
 
293 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  29.77 
 
 
293 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.53 
 
 
746 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.53 
 
 
746 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  27.86 
 
 
290 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  32.81 
 
 
292 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.53 
 
 
746 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.4 
 
 
742 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.62 
 
 
750 aa  142  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 
292 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  27.44 
 
 
286 aa  142  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  29.37 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  31.75 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  29.39 
 
 
367 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.19 
 
 
746 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.3 
 
 
748 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  30.15 
 
 
294 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 
364 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  29.8 
 
 
286 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  30.08 
 
 
286 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.2 
 
 
746 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  28.33 
 
 
534 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  34.26 
 
 
280 aa  139  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  29.76 
 
 
286 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 
280 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  31.05 
 
 
373 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 
302 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  30.92 
 
 
293 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.52 
 
 
735 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  27.21 
 
 
286 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  29.84 
 
 
370 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  28.68 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  27.82 
 
 
298 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.05 
 
 
746 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.38 
 
 
746 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  28.9 
 
 
294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  33.58 
 
 
362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  31.34 
 
 
366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  27.86 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  26.02 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  30.31 
 
 
290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.15 
 
 
752 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  27 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  27.24 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  31.33 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.52 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  27.7 
 
 
297 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  29.58 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1163  prephenate dehydrogenase  30.33 
 
 
283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  28.91 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  25.9 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  31.68 
 
 
369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  30.15 
 
 
535 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  27.52 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  27.52 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  28.02 
 
 
308 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  28 
 
 
291 aa  126  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  28.04 
 
 
288 aa  126  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.78 
 
 
311 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.78 
 
 
311 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  32.12 
 
 
363 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  32.12 
 
 
363 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.04 
 
 
310 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  27.73 
 
 
329 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1908  prephenate dehydrogenase  29.58 
 
 
354 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  27.73 
 
 
329 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.52 
 
 
313 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  27.01 
 
 
328 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.15 
 
 
311 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  29.96 
 
 
379 aa  123  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  30 
 
 
330 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  26.91 
 
 
364 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  29.67 
 
 
276 aa  122  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  28.68 
 
 
313 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 
339 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  26.85 
 
 
290 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  27.34 
 
 
322 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  24.92 
 
 
334 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  26.4 
 
 
287 aa  122  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.37 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>