275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1331 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
390 aa  780    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  61.99 
 
 
379 aa  467  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  34.42 
 
 
364 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  30.96 
 
 
365 aa  190  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  31.04 
 
 
363 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  31.04 
 
 
363 aa  187  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  31.75 
 
 
362 aa  186  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  33.15 
 
 
367 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 
367 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  32.34 
 
 
366 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  32.64 
 
 
378 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  32.63 
 
 
366 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  32.34 
 
 
366 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  36.19 
 
 
364 aa  177  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  32.04 
 
 
366 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  32.04 
 
 
366 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  37.58 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  31.74 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  31.34 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  30.75 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  31.75 
 
 
378 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  37.95 
 
 
339 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  31.44 
 
 
366 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.98 
 
 
770 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.24 
 
 
780 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  34.15 
 
 
280 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  36.97 
 
 
290 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  33.96 
 
 
373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  34.01 
 
 
299 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  33.68 
 
 
370 aa  162  7e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1163  prephenate dehydrogenase  34.26 
 
 
283 aa  162  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.97 
 
 
750 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.8 
 
 
742 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.71 
 
 
778 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  32.09 
 
 
280 aa  155  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  36.52 
 
 
334 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  26.91 
 
 
368 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.44 
 
 
748 aa  153  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  34.43 
 
 
319 aa  152  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  37.68 
 
 
534 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  36.91 
 
 
293 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  36.91 
 
 
293 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  37.13 
 
 
375 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  31.55 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  34.68 
 
 
293 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  36.97 
 
 
535 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 
288 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  32.06 
 
 
290 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  36.73 
 
 
292 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  34.06 
 
 
360 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  33.78 
 
 
301 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  32.29 
 
 
286 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.13 
 
 
746 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  33.01 
 
 
334 aa  143  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  34.24 
 
 
291 aa  142  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  35.17 
 
 
308 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  32.08 
 
 
286 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.55 
 
 
746 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  33.92 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  33.43 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.27 
 
 
735 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  31.47 
 
 
361 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.9 
 
 
746 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  31.74 
 
 
286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.23 
 
 
746 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  35.84 
 
 
357 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  35.86 
 
 
298 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.55 
 
 
307 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.89 
 
 
746 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  35.02 
 
 
302 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  29.68 
 
 
280 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  29.72 
 
 
286 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  34.44 
 
 
288 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.48 
 
 
746 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  32.03 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  36.21 
 
 
308 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  36.21 
 
 
322 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.29 
 
 
313 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 
313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  31.48 
 
 
360 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  35.52 
 
 
329 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  35.52 
 
 
329 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  32.93 
 
 
361 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 
308 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  32.7 
 
 
322 aa  136  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  26.57 
 
 
270 aa  135  9e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  36.36 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  31.61 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  34.27 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  33.68 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.12 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  35.74 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0497  prephenate dehydrogenase  33.79 
 
 
293 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0756332  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  34.39 
 
 
291 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.19 
 
 
308 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.85 
 
 
312 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 
311 aa  133  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  34.14 
 
 
356 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>