282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2572 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2572  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 289 aa  590  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474383  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2807  Prephenate dehydrogenase  64.93 
 
 		 289 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2408  Prephenate dehydrogenase  58.89 
 
 		 289 aa  349  4e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0018  prephenate dehydrogenase  53.47 
 
 		 288 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2431  Prephenate dehydrogenase  54.48 
 
 		 288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2049  prephenate dehydrogenase  52.46 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2164  Prephenate dehydrogenase  52.84 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.854541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  30.64 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  30.24 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  28.18 
 
 		 366 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  30.56 
 
 		 373 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  28.23 
 
 		 334 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  29.45 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  31.51 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  28.11 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.01 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  30.07 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.19 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  30.86 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  31.38 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.31 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.65 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  29.37 
 
 		 287 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  29.15 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 		 290 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  29.97 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  28.23 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.64 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  30.42 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  28.62 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  29.32 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  30.42 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.67 
 
 		 319 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  28.95 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.49 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.57 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.43 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.72 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  30.99 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  27.09 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  27.09 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  26.98 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  27.11 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  26.87 
 
 		 322 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  27.3 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.3 
 
 		 770 aa  102  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  29.49 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.06 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  28.67 
 
 		 362 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  27.76 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 		 369 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  27.18 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  27.7 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.88 
 
 		 780 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  27.62 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.06 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  27.59 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  26.24 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  27.02 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  31.42 
 
 		 276 aa  99.8  5e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  28.12 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  28.24 
 
 		 292 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  29.92 
 
 		 370 aa  99.4  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  27.9 
 
 		 369 aa  99.4  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  28.03 
 
 		 293 aa  99  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  28.03 
 
 		 293 aa  99  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  28.79 
 
 		 280 aa  99  9e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.82 
 
 		 778 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.25 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.3 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  28.03 
 
 		 366 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2884  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.46 
 
 		 753 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.052366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2947  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.46 
 
 		 749 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  27.54 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  26.21 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.57 
 
 		 742 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  26.83 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  28.03 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  28.03 
 
 		 378 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  29.27 
 
 		 330 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.15 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0924  prephenate dehydrogenase  27.12 
 
 		 338 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.83 
 
 		 314 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  28.03 
 
 		 366 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  28.11 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1832  Prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  27.37 
 
 		 291 aa  96.3  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  27.37 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  25.78 
 
 		 291 aa  95.9  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>