273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2049 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_2049  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 290 aa  590  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2572  prephenate dehydrogenase  52.46 
 
 		 289 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474383  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2807  Prephenate dehydrogenase  54.23 
 
 		 289 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2408  Prephenate dehydrogenase  50 
 
 		 289 aa  289  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2431  Prephenate dehydrogenase  45.91 
 
 		 288 aa  271  9e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2164  Prephenate dehydrogenase  47.16 
 
 		 288 aa  268  8e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.854541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0018  prephenate dehydrogenase  44.96 
 
 		 288 aa  267  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  32.32 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 		 373 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  30.58 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  34.86 
 
 		 328 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  35.86 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 339 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  30.98 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  27.5 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  29.31 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  32.5 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  30.48 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  30.66 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.12 
 
 		 364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  29.58 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  29.21 
 
 		 334 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  28.28 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.29 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  31.33 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  29.58 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  30.48 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  29.3 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  28.62 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 356 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  29.1 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.77 
 
 		 780 aa  106  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  32.62 
 
 		 330 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  30.82 
 
 		 286 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  26.22 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.66 
 
 		 770 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.14 
 
 		 312 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  26.22 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  29.33 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  30.66 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.4 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  28.28 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.25 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  31.07 
 
 		 534 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  29.03 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  31.08 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.2 
 
 		 742 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.27 
 
 		 746 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.89 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  32.23 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  29.45 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  30.67 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  30.67 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  29.25 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  30.16 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  29.93 
 
 		 329 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  28.12 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.9 
 
 		 746 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.19 
 
 		 750 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 		 369 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  29.29 
 
 		 368 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.9 
 
 		 746 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.57 
 
 		 778 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.55 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.9 
 
 		 746 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  30.41 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  28.23 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  30.36 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 		 366 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  29.03 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  29.54 
 
 		 298 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.34 
 
 		 735 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.14 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  27.66 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.14 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  29.75 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.58 
 
 		 314 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  26.57 
 
 		 366 aa  99  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  32.68 
 
 		 367 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 		 361 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  26.57 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.11 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.82 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  26.57 
 
 		 378 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  29.12 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  30.22 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.58 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  26.57 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.62 
 
 		 748 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0106  Prephenate dehydrogenase  32.02 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0924  prephenate dehydrogenase  30.27 
 
 		 338 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>