275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0018 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0018  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 288 aa  597  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2572  prephenate dehydrogenase  53.47 
 
 		 289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474383  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2807  Prephenate dehydrogenase  55.79 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2408  Prephenate dehydrogenase  53.17 
 
 		 289 aa  318  9e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2431  Prephenate dehydrogenase  50.18 
 
 		 288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2164  Prephenate dehydrogenase  48.23 
 
 		 288 aa  273  3e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.854541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2049  prephenate dehydrogenase  44.96 
 
 		 290 aa  267  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  32.12 
 
 		 290 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  32.53 
 
 		 298 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  31.23 
 
 		 292 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  29.83 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 		 280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  31.25 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  32.43 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  29.43 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 		 293 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  30.1 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.37 
 
 		 770 aa  113  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  30.27 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  29.69 
 
 		 364 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  25.34 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  25.6 
 
 		 365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  31.6 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  26.07 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  29.74 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  29.74 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 		 328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  31.62 
 
 		 330 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  30.93 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  31.85 
 
 		 313 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  29.77 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  31.94 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  27.3 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  28.05 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.89 
 
 		 778 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  28.98 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  32.12 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.89 
 
 		 780 aa  107  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  29.11 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  29.87 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  29.45 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  30.46 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 		 369 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  27.61 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.76 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  32.06 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  28.18 
 
 		 367 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  29.24 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  28.19 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  29.77 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  29.17 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  28.97 
 
 		 534 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  28.02 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.24 
 
 		 742 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  29.15 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  30.31 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  26.52 
 
 		 281 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  30.17 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  32.91 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  26.8 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 		 366 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  26.71 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0924  prephenate dehydrogenase  29.67 
 
 		 338 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  28.33 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.23 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  29.47 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  27.18 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.52 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  27.87 
 
 		 368 aa  99.8  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  28.71 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  29.07 
 
 		 366 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.87 
 
 		 750 aa  99.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  26.45 
 
 		 291 aa  99.4  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.33 
 
 		 308 aa  98.6  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 		 378 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  28.86 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  30.84 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  25.99 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  29.02 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.96 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.65 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  30.67 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.95 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>