More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4397 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  100 
 
 
284 aa  580  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  73.75 
 
 
278 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  63.22 
 
 
278 aa  348  4e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  63.22 
 
 
278 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  59.23 
 
 
289 aa  329  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  62.45 
 
 
281 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  56.06 
 
 
283 aa  322  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  50.76 
 
 
323 aa  269  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  46.93 
 
 
308 aa  238  8e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1136  arogenate dehydrogenase  41.41 
 
 
291 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20101  arogenate dehydrogenase  41.41 
 
 
291 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.624497  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  45 
 
 
291 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  35.23 
 
 
279 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  35.61 
 
 
279 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  41.02 
 
 
314 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  35.23 
 
 
279 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  35.23 
 
 
279 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  36.78 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  43.29 
 
 
367 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  34.66 
 
 
293 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  34.66 
 
 
293 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 
290 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  32.88 
 
 
319 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  37.99 
 
 
364 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  34.62 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  35.21 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  32.28 
 
 
297 aa  152  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
286 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  32.52 
 
 
289 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  33.59 
 
 
375 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  31.91 
 
 
280 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  32.37 
 
 
299 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  33.68 
 
 
288 aa  149  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  34.04 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 
279 aa  146  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  34.77 
 
 
287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  33.69 
 
 
286 aa  145  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  30.63 
 
 
293 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  32.52 
 
 
290 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  34.51 
 
 
329 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  34.51 
 
 
329 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
286 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 
334 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  32.88 
 
 
291 aa  142  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  35.57 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.75 
 
 
746 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.1 
 
 
746 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  33.56 
 
 
328 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  34.9 
 
 
313 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0928  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
296 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582282  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 
322 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  32.28 
 
 
288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.86 
 
 
746 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  26.88 
 
 
365 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  33.8 
 
 
329 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  35.13 
 
 
370 aa  135  8e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 
328 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  34.87 
 
 
356 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  31.25 
 
 
301 aa  135  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.67 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  29.79 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.75 
 
 
746 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  31.43 
 
 
535 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  34.15 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  31.41 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  30.66 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.14 
 
 
735 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  28.17 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
310 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.25 
 
 
311 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  32.25 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  29.47 
 
 
367 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  32.25 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  33.99 
 
 
364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  27.92 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  31.34 
 
 
534 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  29.88 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.34 
 
 
746 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  33.84 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  31.88 
 
 
292 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.5 
 
 
752 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.34 
 
 
746 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0924  prephenate dehydrogenase  33.8 
 
 
338 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
334 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.92 
 
 
313 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  35.77 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  34.07 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.02 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  28.98 
 
 
294 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 
366 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 
367 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  28.62 
 
 
294 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.36 
 
 
746 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
280 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  29.63 
 
 
282 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  28.24 
 
 
291 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  29.51 
 
 
280 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0199  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.86 
 
 
749 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2574  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.86 
 
 
749 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>