More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_17521 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  100 
 
 		 279 aa  553  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  75.38 
 
 		 279 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  74.62 
 
 		 279 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  73.08 
 
 		 279 aa  397  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1136  arogenate dehydrogenase  42.86 
 
 		 291 aa  251  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20101  arogenate dehydrogenase  43.24 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.624497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  41.38 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  37.45 
 
 		 314 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  37.41 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  35.23 
 
 		 284 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  37.01 
 
 		 291 aa  198  6e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  37.31 
 
 		 278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  36.92 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  34.38 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  34.72 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  36.51 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  34.5 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  34.75 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  35.13 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  31.77 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  34.67 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  29.81 
 
 		 364 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  29.58 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  28.63 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  25.09 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.41 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  30.94 
 
 		 367 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 		 366 aa  135  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  29.81 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  28.67 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  27.6 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  25.62 
 
 		 297 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.68 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  29.93 
 
 		 368 aa  132  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  25.26 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  28.01 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  29.93 
 
 		 367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.06 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  27.96 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.59 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.06 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  29.39 
 
 		 280 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.22 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.52 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  29.43 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.56 
 
 		 312 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  28.88 
 
 		 379 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  27.18 
 
 		 293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  27.37 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  31.78 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  31.21 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.87 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.44 
 
 		 314 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.56 
 
 		 746 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.53 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  27.21 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.83 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  25.17 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0106  Prephenate dehydrogenase  32.28 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.35 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.87 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  25.8 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 		 366 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  28.11 
 
 		 366 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  27.92 
 
 		 356 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 		 366 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.96 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 		 378 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.62 
 
 		 319 aa  122  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 		 366 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  30.39 
 
 		 365 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  28.11 
 
 		 366 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.78 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  25.98 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  26.13 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.62 
 
 		 750 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  24.15 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.55 
 
 		 742 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  24.83 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  31.78 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  27.76 
 
 		 378 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  25.7 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  26.41 
 
 		 534 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.4 
 
 		 752 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  23.45 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.67 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  26.33 
 
 		 535 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.21 
 
 		 746 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  25.44 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.21 
 
 		 746 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.9 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.09 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  29.63 
 
 		 276 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  27.4 
 
 		 369 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  25.71 
 
 		 293 aa  118  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>