268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_22941 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  100 
 
 
314 aa  627  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  71.48 
 
 
308 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  71.81 
 
 
291 aa  351  8.999999999999999e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  60 
 
 
288 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1136  arogenate dehydrogenase  54.55 
 
 
291 aa  305  6e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20101  arogenate dehydrogenase  54.17 
 
 
291 aa  302  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.624497  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  37.69 
 
 
279 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  46.95 
 
 
323 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  37.45 
 
 
279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  43.3 
 
 
278 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  36.68 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  42.91 
 
 
278 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  36.68 
 
 
279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  39.41 
 
 
283 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  41 
 
 
284 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  40.53 
 
 
289 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  42.25 
 
 
281 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  39.45 
 
 
278 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.1 
 
 
307 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.1 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  38.19 
 
 
370 aa  129  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.03 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  31.77 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  31.77 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  30.22 
 
 
270 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.23 
 
 
301 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  33.79 
 
 
313 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  40.5 
 
 
318 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.6 
 
 
311 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  34.06 
 
 
286 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.29 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  27.46 
 
 
280 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.21 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.1 
 
 
750 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.08 
 
 
312 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  32.51 
 
 
364 aa  119  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  34.63 
 
 
375 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  29.86 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.98 
 
 
746 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.01 
 
 
308 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 
328 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  36.24 
 
 
285 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.03 
 
 
311 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.38 
 
 
319 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  34.16 
 
 
309 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.58 
 
 
313 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  39.11 
 
 
360 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  34.04 
 
 
286 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  30.28 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.98 
 
 
746 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  32.03 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  32.39 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.89 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  31.93 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  30.42 
 
 
280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.36 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  29.72 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.34 
 
 
311 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.34 
 
 
311 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  32.41 
 
 
307 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.79 
 
 
312 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 
297 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  40.51 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  34.58 
 
 
360 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  31.79 
 
 
288 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  30.22 
 
 
282 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.62 
 
 
746 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  32.27 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  33.57 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.14 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  30.8 
 
 
535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  31.62 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  33.93 
 
 
367 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.79 
 
 
321 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.98 
 
 
746 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  34.6 
 
 
364 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.99 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  31.07 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  31.07 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.93 
 
 
735 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  35.74 
 
 
323 aa  109  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 
293 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  27.52 
 
 
276 aa  109  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  29.48 
 
 
286 aa  109  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0106  Prephenate dehydrogenase  33.19 
 
 
290 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.69 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  35.83 
 
 
356 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 
290 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.98 
 
 
746 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  31.53 
 
 
330 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.39 
 
 
310 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  30.42 
 
 
322 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.14 
 
 
746 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.62 
 
 
311 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.49 
 
 
746 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 
284 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  31.67 
 
 
279 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  30.92 
 
 
285 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.9 
 
 
313 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  29.33 
 
 
318 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>