267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0168 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 318 aa  589  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36910  prephenate dehydrogenase  61.88 
 
 		 322 aa  305  9.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  52.75 
 
 		 323 aa  248  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4962  prephenate dehydrogenase  50.98 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5343  prephenate dehydrogenase  50.98 
 
 		 332 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5050  prephenate dehydrogenase  50.98 
 
 		 332 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1212  prephenate dehydrogenase  50.66 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.827546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5596  prephenate dehydrogenase  50.33 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4050  Prephenate dehydrogenase  47.47 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0308  Prephenate dehydrogenase  49.68 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  42.99 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0236  Prephenate dehydrogenase  49.77 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  27.54 
 
 		 365 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0466  Prephenate dehydrogenase  48.6 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.02 
 
 		 750 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  39.92 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0337  Prephenate dehydrogenase  37.69 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139074 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  42.78 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  38.59 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  34.35 
 
 		 373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  30.91 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  29.79 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  36.09 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  31.42 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  41.44 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  33.83 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  45.73 
 
 		 291 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  34.39 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  43.28 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  33.81 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  35.97 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  36.07 
 
 		 339 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  32.83 
 
 		 288 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.13 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0249  prephenate dehydrogenase  38.73 
 
 		 354 aa  105  7e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.524671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  33.06 
 
 		 364 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  33.94 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  35.71 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  35.95 
 
 		 535 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  29.22 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.73 
 
 		 748 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1136  arogenate dehydrogenase  31.05 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  32.49 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.74 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  36.23 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  31.91 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  32.13 
 
 		 278 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  34.08 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  36.33 
 
 		 534 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  34.05 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  31.97 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  30.2 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  31.05 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  35.43 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20101  arogenate dehydrogenase  29.68 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.624497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  30.63 
 
 		 367 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  30.2 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0483  prephenate dehydrogenase  32.29 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  25 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0968  Prephenate dehydrogenase  47.78 
 
 		 331 aa  99.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  32.28 
 
 		 293 aa  100  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  38.71 
 
 		 361 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  36.55 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  27.38 
 
 		 366 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  27.76 
 
 		 366 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  46.41 
 
 		 388 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  27.76 
 
 		 378 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  33.46 
 
 		 286 aa  99.4  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  27.76 
 
 		 366 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  27.76 
 
 		 366 aa  99  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  32.63 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  32.8 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  27.38 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.92 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  27.76 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.07 
 
 		 735 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0497  prephenate dehydrogenase  34.74 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0756332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.35 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.96 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1908  prephenate dehydrogenase  34.27 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  32.63 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  32.38 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  32.94 
 
 		 286 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.74 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.15 
 
 		 746 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.21 
 
 		 746 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.5 
 
 		 311 aa  97.1  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.21 
 
 		 746 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.18 
 
 		 780 aa  96.3  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  34.66 
 
 		 283 aa  96.3  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  26.46 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  33.96 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.13 
 
 		 314 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  36.71 
 
 		 367 aa  95.9  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.33 
 
 		 745 aa  95.5  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  35.08 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.245875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>