263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5596 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5596  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 325 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1212  prephenate dehydrogenase  84.08 
 
 		 314 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.827546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5343  prephenate dehydrogenase  77.78 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5050  prephenate dehydrogenase  77.78 
 
 		 332 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4962  prephenate dehydrogenase  77.96 
 
 		 314 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308401  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  72.41 
 
 		 323 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4050  Prephenate dehydrogenase  53.57 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  50 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36910  prephenate dehydrogenase  51.96 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0308  Prephenate dehydrogenase  48.86 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0236  Prephenate dehydrogenase  40.83 
 
 		 312 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  45.7 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  37.38 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0466  Prephenate dehydrogenase  39.93 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0483  prephenate dehydrogenase  30.13 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0249  prephenate dehydrogenase  36.03 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.524671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  30.84 
 
 		 369 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3757  prephenate dehydrogenase  46.12 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673917  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0968  Prephenate dehydrogenase  40.94 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  36.4 
 
 		 339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  30.25 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  29.81 
 
 		 366 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  29.94 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  29.94 
 
 		 378 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  29.94 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  32.82 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  35.21 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  36.1 
 
 		 388 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  34.47 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  34.47 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  38.01 
 
 		 371 aa  109  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.07 
 
 		 750 aa  109  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  29.26 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  29.3 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  38.68 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  29.62 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  36.8 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  34.15 
 
 		 287 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  37.29 
 
 		 375 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  36.67 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  37.05 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  37.22 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.02 
 
 		 746 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  33.46 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  35.14 
 
 		 292 aa  102  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.45 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  34.83 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  33.57 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0337  Prephenate dehydrogenase  34.32 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  32.1 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.54 
 
 		 735 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  36 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  32.1 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  36.78 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  34.25 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  28.2 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  37.97 
 
 		 361 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.73 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  32.78 
 
 		 278 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.92 
 
 		 746 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  27.4 
 
 		 366 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  34.02 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.87 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.92 
 
 		 746 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.63 
 
 		 752 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  36.15 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 		 369 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  32.67 
 
 		 286 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  32.08 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.68 
 
 		 746 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  36.82 
 
 		 370 aa  96.3  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  25.63 
 
 		 280 aa  95.9  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.12 
 
 		 746 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  33.71 
 
 		 288 aa  95.9  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  34.29 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  31.94 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  30.05 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.29 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.29 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  32.21 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.29 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  33.6 
 
 		 303 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.22 
 
 		 746 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  30.61 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  27.7 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  36.69 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  38.29 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  34.35 
 
 		 535 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.21 
 
 		 778 aa  94  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  29.66 
 
 		 286 aa  94.4  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  34.75 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  25.08 
 
 		 363 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.52 
 
 		 770 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  25.08 
 
 		 363 aa  93.6  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  34.52 
 
 		 310 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  35.63 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  34.87 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>