More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0236 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0236  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 312 aa  605  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  51.75 
 
 		 318 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5596  prephenate dehydrogenase  43.42 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1212  prephenate dehydrogenase  44.04 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.827546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  46.64 
 
 		 334 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  39.67 
 
 		 323 aa  169  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5343  prephenate dehydrogenase  41.12 
 
 		 332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5050  prephenate dehydrogenase  41.12 
 
 		 332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4962  prephenate dehydrogenase  41.39 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0466  Prephenate dehydrogenase  46.4 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36910  prephenate dehydrogenase  49.78 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4050  Prephenate dehydrogenase  39.81 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  43.35 
 
 		 348 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  39.61 
 
 		 329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  35.6 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0308  Prephenate dehydrogenase  41.08 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3757  prephenate dehydrogenase  42.2 
 
 		 361 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673917  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  35.66 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  32.25 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  26.05 
 
 		 362 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  38.75 
 
 		 390 aa  119  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  31.62 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  35.89 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0968  Prephenate dehydrogenase  42.62 
 
 		 331 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  37.78 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  29.58 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  35.15 
 
 		 373 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  31.02 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.23 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.23 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.59 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  30.42 
 
 		 368 aa  109  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  26.79 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  33.56 
 
 		 328 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  28.47 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1638  Prephenate dehydrogenase  37.65 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0249  prephenate dehydrogenase  35.66 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.524671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  27.97 
 
 		 366 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  36.52 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.81 
 
 		 313 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  29.37 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  27.78 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  27.78 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  27.78 
 
 		 378 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  27.78 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.36 
 
 		 750 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2828  Prephenate dehydrogenase  43.87 
 
 		 357 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00010638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  31.35 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  37.13 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  27.97 
 
 		 366 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  34.77 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  27.78 
 
 		 366 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  31.18 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  28.12 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.37 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  36.88 
 
 		 367 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  32.19 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  32.04 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  36.1 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.45 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  33.98 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  36.43 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  40.61 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  34.09 
 
 		 317 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.37 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  40.82 
 
 		 388 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  30.58 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  30.71 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  35.88 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  35.88 
 
 		 291 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  30.58 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0591  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.366481  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0576  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00152184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  31.79 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  27.02 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.04 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  34.66 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  29.5 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  34.6 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  26.06 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0483  prephenate dehydrogenase  31.2 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  32.39 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  26.06 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1908  prephenate dehydrogenase  26.05 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  25.74 
 
 		 280 aa  99.8  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  30.92 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  32.5 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.61 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.05 
 
 		 314 aa  99  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.93 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.86 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  32.73 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0337  Prephenate dehydrogenase  35.32 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.13 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.21 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  29.43 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.86 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.27 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>