284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0576 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0576  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 253 aa  520  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00152184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0591  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 253 aa  520  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.366481  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 270 aa  119  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  32.38 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  32.48 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  29.71 
 
 		 373 aa  108  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  29.67 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  30.97 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  31.64 
 
 		 364 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  25.46 
 
 		 293 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  29.12 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 279 aa  99.4  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  26.88 
 
 		 328 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2807  Prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 		 289 aa  96.7  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  26.94 
 
 		 294 aa  96.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  26.16 
 
 		 328 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  28.26 
 
 		 319 aa  95.1  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  30.37 
 
 		 282 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  29.08 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  28.77 
 
 		 339 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  28.14 
 
 		 365 aa  92.4  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  27.51 
 
 		 289 aa  92  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  26.49 
 
 		 367 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  23.93 
 
 		 322 aa  92  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  27.61 
 
 		 285 aa  91.7  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2431  Prephenate dehydrogenase  29.17 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  26.14 
 
 		 356 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 		 348 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  28.25 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  28.25 
 
 		 293 aa  90.1  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2408  Prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 		 289 aa  90.1  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  24.18 
 
 		 330 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  27.44 
 
 		 367 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  29.08 
 
 		 370 aa  89.7  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  29.63 
 
 		 334 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2164  Prephenate dehydrogenase  29.36 
 
 		 288 aa  89  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.854541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  27.11 
 
 		 290 aa  87.8  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  27.07 
 
 		 329 aa  88.2  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1665  Prephenate dehydrogenase  29.1 
 
 		 281 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000668166  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  27.16 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  23.25 
 
 		 301 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  26.23 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  27.48 
 
 		 286 aa  86.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  25.31 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  30.68 
 
 		 334 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  23.25 
 
 		 291 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2572  prephenate dehydrogenase  27.76 
 
 		 289 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474383  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  29.06 
 
 		 355 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2051  Prephenate dehydrogenase  28.99 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.129678  decreased coverage  0.0000000000498492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  30.08 
 
 		 360 aa  86.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  28.03 
 
 		 364 aa  85.9  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  29.11 
 
 		 369 aa  85.5  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  24.28 
 
 		 290 aa  85.1  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  25.31 
 
 		 278 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  27.61 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  26.79 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  25.56 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.04 
 
 		 746 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0018  prephenate dehydrogenase  26.97 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  27.13 
 
 		 375 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  25.37 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  26.37 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.97 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.37 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  23.57 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  25.41 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.52 
 
 		 752 aa  82.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  27.97 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2426  Prephenate dehydrogenase  29.39 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  24.63 
 
 		 292 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.74 
 
 		 746 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.26 
 
 		 735 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  28.41 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.63 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  24.82 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  28.46 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.37 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2049  prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  27.61 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  24.07 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  25.19 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  29.55 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.94 
 
 		 746 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1163  prephenate dehydrogenase  24.25 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  27.14 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.88 
 
 		 746 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  25 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  25.38 
 
 		 361 aa  79  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  25.19 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  26.36 
 
 		 366 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  26.36 
 
 		 378 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0236  Prephenate dehydrogenase  30.62 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  26.36 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  27.41 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  26.15 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  25.97 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  26.36 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  26.36 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>