269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1665 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1665  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
281 aa  553  1e-156  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000668166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 
284 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 
364 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  29.62 
 
 
279 aa  113  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  26.6 
 
 
365 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 
282 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32.74 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32.74 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  33.79 
 
 
373 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  32.38 
 
 
299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  35.51 
 
 
371 aa  109  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  29.08 
 
 
280 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 
366 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  32.38 
 
 
367 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  30.3 
 
 
285 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 
378 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 
366 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 
378 aa  105  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 
366 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 
366 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 
366 aa  104  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  28.83 
 
 
366 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 
292 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  29.45 
 
 
280 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 
379 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 
366 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  36.82 
 
 
367 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  33.8 
 
 
290 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  30.91 
 
 
290 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  31.18 
 
 
294 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  25.37 
 
 
280 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 
369 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  34.52 
 
 
348 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
291 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  30.99 
 
 
293 aa  99.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.68 
 
 
301 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.96 
 
 
311 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  28.11 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  33.59 
 
 
368 aa  98.2  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 
367 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0106  Prephenate dehydrogenase  33.63 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  30.42 
 
 
300 aa  96.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  25.87 
 
 
280 aa  96.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.74 
 
 
735 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  26.86 
 
 
286 aa  96.3  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  31.47 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  30.91 
 
 
294 aa  95.9  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  33.22 
 
 
286 aa  95.5  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  30.55 
 
 
294 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  28.93 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.54 
 
 
748 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  25.45 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  30.63 
 
 
322 aa  92.4  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1331  Prephenate dehydrogenase  32.73 
 
 
390 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.762233  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  33.69 
 
 
356 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.29 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  34.34 
 
 
361 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  24.03 
 
 
362 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  31.97 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  35.91 
 
 
364 aa  90.1  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  31.45 
 
 
286 aa  89.7  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.62 
 
 
746 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 
292 aa  89.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  24.73 
 
 
363 aa  89  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  29.08 
 
 
288 aa  89.4  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  24.73 
 
 
363 aa  89  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 
301 aa  89.4  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  32.62 
 
 
534 aa  89  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  31.05 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0696  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.23 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  37.89 
 
 
339 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6984  hypothetical protein  31.63 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  26.39 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  30.58 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.67 
 
 
746 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0591  prephenate dehydrogenase  30 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.366481  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  26.88 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  33.9 
 
 
357 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0576  prephenate dehydrogenase  30 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00152184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  30.86 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.47 
 
 
780 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  28.11 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  28.62 
 
 
319 aa  86.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  33.69 
 
 
363 aa  86.3  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1908  prephenate dehydrogenase  24.81 
 
 
354 aa  86.3  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  28.92 
 
 
293 aa  85.9  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  29.97 
 
 
289 aa  85.5  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  29.69 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.47 
 
 
746 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  30.96 
 
 
535 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  32.87 
 
 
288 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  29.17 
 
 
318 aa  84  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.21 
 
 
752 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  25.64 
 
 
369 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.12 
 
 
746 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  32.53 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.38 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.42 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>