279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0249 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0249  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 354 aa  721    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.524671  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0483  prephenate dehydrogenase  47.15 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  45.26 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0968  Prephenate dehydrogenase  42.21 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  39.49 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  34.2 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4050  Prephenate dehydrogenase  39.02 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  37.98 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1212  prephenate dehydrogenase  38.61 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.827546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5343  prephenate dehydrogenase  37.75 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5050  prephenate dehydrogenase  37.75 
 
 		 332 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4962  prephenate dehydrogenase  37.65 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5596  prephenate dehydrogenase  37.6 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  29.97 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36910  prephenate dehydrogenase  40 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3757  prephenate dehydrogenase  38.37 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673917  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  31.74 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  36.48 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  38.14 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0308  Prephenate dehydrogenase  36.48 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  31.85 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  27.62 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  30.43 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  34.19 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  32.84 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.18 
 
 		 748 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  26.53 
 
 		 366 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  35.19 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  26.1 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  36.03 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  27.09 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  32.74 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  27.09 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  25.85 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  33.5 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  25.85 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  25.85 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  25.85 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  31.64 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  32.92 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  31.77 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  35.32 
 
 		 287 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  34.18 
 
 		 286 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  32.35 
 
 		 293 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  25.85 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  32.25 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  25.61 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  33.48 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  25.09 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 		 294 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 290 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  33.58 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0337  Prephenate dehydrogenase  31.2 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0466  Prephenate dehydrogenase  37.13 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  34.36 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  33.92 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.09 
 
 		 745 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  30.54 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  24.83 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  32.77 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  33.86 
 
 		 288 aa  103  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  33.78 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  29.62 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  32.24 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  31.23 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  29.14 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  29.34 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.23 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.11 
 
 		 735 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  32.95 
 
 		 285 aa  99.4  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  34.57 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  32.77 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  35.59 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  30.34 
 
 		 278 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  36.05 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.36 
 
 		 746 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  36.65 
 
 		 279 aa  97.1  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 		 298 aa  97.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  35.19 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  33.63 
 
 		 369 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  32.35 
 
 		 322 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 288 aa  96.3  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.51 
 
 		 312 aa  95.9  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  30.92 
 
 		 281 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  27.18 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0205  Prephenate dehydrogenase  35.9 
 
 		 288 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  33.6 
 
 		 310 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  31.95 
 
 		 292 aa  94.4  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  28.06 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  35.2 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0236  Prephenate dehydrogenase  36.36 
 
 		 312 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  29.07 
 
 		 286 aa  92.8  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>