263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5050 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5343  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 332 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5050  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 332 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4962  prephenate dehydrogenase  99.68 
 
 		 314 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5596  prephenate dehydrogenase  77.78 
 
 		 325 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  74.84 
 
 		 323 aa  471  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1212  prephenate dehydrogenase  76.36 
 
 		 314 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.827546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4050  Prephenate dehydrogenase  53.18 
 
 		 322 aa  275  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  50.98 
 
 		 318 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36910  prephenate dehydrogenase  51.63 
 
 		 322 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0308  Prephenate dehydrogenase  50.97 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  37.05 
 
 		 334 aa  142  8e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0236  Prephenate dehydrogenase  39.66 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0466  Prephenate dehydrogenase  39.81 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  37.15 
 
 		 375 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0249  prephenate dehydrogenase  36.13 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.524671  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0483  prephenate dehydrogenase  31.11 
 
 		 361 aa  117  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0968  Prephenate dehydrogenase  38.74 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  41.32 
 
 		 348 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  38.29 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  36.48 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  38.08 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.75 
 
 		 750 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  34.04 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  34.52 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  33.7 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  34.69 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  34.69 
 
 		 293 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  30.16 
 
 		 367 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  31.15 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  26.57 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.77 
 
 		 746 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  34.68 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  34.82 
 
 		 293 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  30.48 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  30.85 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  31.06 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.37 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.09 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  30.17 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.09 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  35.12 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  32.97 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  36.12 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  37.4 
 
 		 388 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3757  prephenate dehydrogenase  38.14 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673917  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2462  prephenate dehydrogenase  34.75 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  33.62 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  32.99 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  29.24 
 
 		 280 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.62 
 
 		 746 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 		 369 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  35.23 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  35.19 
 
 		 534 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  35.66 
 
 		 286 aa  99.4  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  30.96 
 
 		 320 aa  99.4  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.52 
 
 		 770 aa  99.4  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  34.96 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  30.42 
 
 		 278 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  31.06 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.29 
 
 		 778 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  29.97 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.62 
 
 		 746 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.02 
 
 		 746 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.02 
 
 		 746 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.06 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  33.08 
 
 		 286 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  33.48 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  27.17 
 
 		 280 aa  97.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.09 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.83 
 
 		 310 aa  96.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  38.14 
 
 		 369 aa  96.3  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  28.63 
 
 		 366 aa  96.3  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  35.08 
 
 		 288 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  34.93 
 
 		 371 aa  96.3  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  34.8 
 
 		 288 aa  95.9  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.93 
 
 		 746 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  34.13 
 
 		 535 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.1 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1584  prephenate dehydrogenase  35.86 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406004 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  32.81 
 
 		 369 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2947  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.85 
 
 		 749 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2884  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.85 
 
 		 753 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.052366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  30.68 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.38 
 
 		 735 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.29 
 
 		 780 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  33.71 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0928  prephenate dehydrogenase  36.36 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.582282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  33.71 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  34.05 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  35.41 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  27.34 
 
 		 280 aa  94  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  32.09 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  34.38 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.53 
 
 		 745 aa  93.6  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  39.13 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>