291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0968 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0968  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
331 aa  622  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  52.98 
 
 
334 aa  255  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0249  prephenate dehydrogenase  43.87 
 
 
354 aa  178  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.524671  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  41.74 
 
 
329 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0483  prephenate dehydrogenase  36 
 
 
361 aa  157  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  44.23 
 
 
348 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1212  prephenate dehydrogenase  39.68 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.827546  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  40.16 
 
 
367 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  38.6 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13786  prephenate dehydrogenase  36.28 
 
 
323 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.791887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5343  prephenate dehydrogenase  40.22 
 
 
332 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.359036  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5050  prephenate dehydrogenase  40.22 
 
 
332 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546878  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4962  prephenate dehydrogenase  39.85 
 
 
314 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5596  prephenate dehydrogenase  42.54 
 
 
325 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  27.68 
 
 
365 aa  132  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3757  prephenate dehydrogenase  43.85 
 
 
361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673917  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.69 
 
 
746 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  37.76 
 
 
290 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  36.24 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  38.93 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.66 
 
 
752 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  37.96 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  41.42 
 
 
375 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  37.91 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 
286 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4050  Prephenate dehydrogenase  38.58 
 
 
322 aa  126  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  38.02 
 
 
286 aa  125  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36910  prephenate dehydrogenase  45.93 
 
 
322 aa  126  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  38.17 
 
 
288 aa  126  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  38.22 
 
 
360 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.93 
 
 
735 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  32.25 
 
 
299 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.77 
 
 
313 aa  124  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  37.69 
 
 
286 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.84 
 
 
746 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 
293 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.03 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.04 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  28.62 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.35 
 
 
742 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  41.3 
 
 
388 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  37.4 
 
 
288 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.27 
 
 
313 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  35.23 
 
 
320 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  38.46 
 
 
534 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  36.8 
 
 
312 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  37.97 
 
 
535 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  27.11 
 
 
366 aa  119  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.07 
 
 
313 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  29.79 
 
 
367 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.85 
 
 
298 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  34.83 
 
 
301 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.69 
 
 
746 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.41 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.57 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  34.83 
 
 
291 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.22 
 
 
746 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.17 
 
 
746 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.17 
 
 
746 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.56 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  32.53 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.2 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  36.9 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.19 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  35.69 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.29 
 
 
746 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  30.05 
 
 
369 aa  114  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  35.23 
 
 
313 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.8 
 
 
311 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0466  Prephenate dehydrogenase  44.1 
 
 
306 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.17 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  36.34 
 
 
373 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  28.62 
 
 
369 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  28.77 
 
 
366 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  28.42 
 
 
366 aa  112  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  40.57 
 
 
357 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.23 
 
 
310 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  37 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  37 
 
 
311 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1873  Prephenate dehydrogenase  36.88 
 
 
312 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  44.17 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  28.42 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  28.42 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  35.45 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.51 
 
 
748 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  28.42 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  28.67 
 
 
362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  36.48 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1592  prephenate dehydrogenase  36.88 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  36.47 
 
 
360 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  29.04 
 
 
364 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  36.88 
 
 
293 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  28.62 
 
 
366 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  28.42 
 
 
366 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  27.72 
 
 
366 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  37.12 
 
 
369 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.84 
 
 
308 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  37.98 
 
 
285 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>