296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2019 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
289 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  64.62 
 
 
278 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  64.23 
 
 
278 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  61.24 
 
 
278 aa  335  7e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  59.54 
 
 
284 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  57.46 
 
 
283 aa  315  8e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  57.69 
 
 
281 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  50.57 
 
 
323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  44.56 
 
 
308 aa  232  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20101  arogenate dehydrogenase  42.75 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.624497  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1136  arogenate dehydrogenase  41.96 
 
 
291 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  40.54 
 
 
288 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  43.68 
 
 
291 aa  200  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  40.53 
 
 
314 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  36.51 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  36.11 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  36.11 
 
 
279 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  35.4 
 
 
299 aa  178  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  35.32 
 
 
279 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  34.15 
 
 
293 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  34.15 
 
 
293 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  41.3 
 
 
367 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  34.52 
 
 
534 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  31.67 
 
 
289 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  32.53 
 
 
297 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  32.2 
 
 
292 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 
291 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.28 
 
 
746 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  33.68 
 
 
368 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0979  prephenate dehydrogenase  32.88 
 
 
310 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  30.98 
 
 
334 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 
280 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.28 
 
 
746 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.22 
 
 
735 aa  148  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  34.52 
 
 
535 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  32.83 
 
 
375 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  36.02 
 
 
364 aa  147  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 
293 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.92 
 
 
746 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  31.9 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  32.73 
 
 
286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3004  Prephenate dehydrogenase  32.19 
 
 
313 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548838  normal  0.0491743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  30.54 
 
 
295 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  32.73 
 
 
286 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  31.54 
 
 
294 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  32.32 
 
 
308 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  30.96 
 
 
367 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  32.73 
 
 
364 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.86 
 
 
746 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.8 
 
 
752 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  30.94 
 
 
290 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  30.94 
 
 
286 aa  143  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 
290 aa  142  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  30.21 
 
 
319 aa  142  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.51 
 
 
746 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  32.17 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 
366 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  30.41 
 
 
328 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.52 
 
 
746 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  30 
 
 
298 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 
287 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  31.43 
 
 
286 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  31.21 
 
 
303 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  29.79 
 
 
292 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  32.03 
 
 
288 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  33.86 
 
 
370 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 
302 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  30.64 
 
 
322 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  29.47 
 
 
288 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  29.08 
 
 
300 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.45 
 
 
746 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  29.73 
 
 
328 aa  135  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 
378 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 
366 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  28.99 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  28.99 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  28.99 
 
 
366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  28.99 
 
 
378 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.64 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.47 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.72 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.72 
 
 
742 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  28.99 
 
 
366 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 
286 aa  134  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  31.31 
 
 
329 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  29.75 
 
 
270 aa  133  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  27.66 
 
 
286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  34.13 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  31.56 
 
 
367 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.08 
 
 
748 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  29.68 
 
 
294 aa  132  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 
365 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0497  prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 
293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0756332  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  30.9 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  29.96 
 
 
366 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  30.27 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 
308 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>