271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1945 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1945  arogenate dehydrogenase  100 
 
 
291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.877441  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  78.28 
 
 
308 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22941  arogenate dehydrogenase  71.81 
 
 
314 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  55.17 
 
 
288 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1136  arogenate dehydrogenase  50 
 
 
291 aa  279  5e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20101  arogenate dehydrogenase  50 
 
 
291 aa  278  6e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.624497  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  44.83 
 
 
278 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  44.44 
 
 
278 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  45.25 
 
 
284 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  36.78 
 
 
279 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0660  arogenate dehydrogenase  48.06 
 
 
323 aa  215  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.3682  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  36.92 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  36.54 
 
 
279 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  36.15 
 
 
279 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  43.68 
 
 
289 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  42.08 
 
 
278 aa  204  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3574  Prephenate dehydrogenase  45.04 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.245875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2701  arogenate dehydrogenase  38.49 
 
 
283 aa  186  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  34.27 
 
 
299 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  31.46 
 
 
282 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.74 
 
 
746 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  31.64 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  37.6 
 
 
375 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.1 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  31.49 
 
 
301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  33.9 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.39 
 
 
746 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  34.86 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  37.61 
 
 
364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  32.17 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  32.17 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  33.22 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  34.86 
 
 
286 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.21 
 
 
746 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  33.69 
 
 
286 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  36.79 
 
 
367 aa  125  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  41.74 
 
 
318 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.72 
 
 
308 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.21 
 
 
746 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  38.78 
 
 
370 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.58 
 
 
310 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  35.17 
 
 
534 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.63 
 
 
311 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
284 aa  123  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.63 
 
 
311 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  32.06 
 
 
369 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.03 
 
 
307 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  32.28 
 
 
302 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  32.39 
 
 
286 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.8 
 
 
746 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  34.01 
 
 
308 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  34.41 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 
292 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.24 
 
 
313 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  34.39 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  34.26 
 
 
535 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  38.6 
 
 
360 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  33.11 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.09 
 
 
746 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  33.11 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  29.86 
 
 
285 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  31.93 
 
 
298 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.34 
 
 
311 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.04 
 
 
301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  31.23 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.48 
 
 
746 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.86 
 
 
735 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.47 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  31.8 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.66 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  32.08 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 
366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 
366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 
366 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  32.51 
 
 
298 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.34 
 
 
313 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  30.5 
 
 
285 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  32.29 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  30.9 
 
 
290 aa  116  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 
366 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  39 
 
 
334 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  32.29 
 
 
301 aa  116  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  31.49 
 
 
287 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  31.29 
 
 
378 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 
366 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  34.48 
 
 
364 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  34.48 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  32.61 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.9 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.69 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.97 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1638  Prephenate dehydrogenase  34.94 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000288611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.58 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  30.8 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.45 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  31.29 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.28 
 
 
750 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>