289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0337 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0337  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
295 aa  592  1e-168  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139074 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1828  Prephenate dehydrogenase  37.1 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  40.43 
 
 
367 aa  169  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  37.76 
 
 
286 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  37.59 
 
 
290 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  37.41 
 
 
286 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  35.82 
 
 
286 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  33.68 
 
 
369 aa  162  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  34.28 
 
 
288 aa  162  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  37.77 
 
 
286 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  32.3 
 
 
378 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  33.09 
 
 
280 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  32.38 
 
 
368 aa  155  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  35.25 
 
 
287 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  32.87 
 
 
366 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  32.5 
 
 
366 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  36.46 
 
 
373 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  35.66 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  32.73 
 
 
366 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  36.78 
 
 
299 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  30.36 
 
 
363 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  30.36 
 
 
363 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  32.37 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  31.96 
 
 
378 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  33.09 
 
 
366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  32.97 
 
 
367 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  32.37 
 
 
366 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  36.69 
 
 
302 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  32.37 
 
 
366 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  33.69 
 
 
289 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.66 
 
 
314 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  34.63 
 
 
364 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.36 
 
 
742 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  34.4 
 
 
291 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.9 
 
 
313 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  37.54 
 
 
285 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  34.98 
 
 
298 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  34.41 
 
 
295 aa  149  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  35.97 
 
 
298 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.64 
 
 
312 aa  148  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  35.19 
 
 
328 aa  148  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.99 
 
 
748 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  35.77 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  35.61 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  37.35 
 
 
364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.81 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  32.51 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  35.51 
 
 
356 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  34.16 
 
 
302 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.93 
 
 
308 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5258  prephenate dehydrogenase  36.13 
 
 
307 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.56 
 
 
313 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.44 
 
 
308 aa  145  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  35.04 
 
 
286 aa  145  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  34.27 
 
 
288 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  34.04 
 
 
319 aa  145  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  36.9 
 
 
320 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.8 
 
 
310 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.42 
 
 
313 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 
293 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  34.38 
 
 
297 aa  143  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.55 
 
 
321 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.71 
 
 
313 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.18 
 
 
321 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  35.27 
 
 
318 aa  142  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.56 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  29.03 
 
 
366 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  34.04 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1311  Prephenate dehydrogenase  33.81 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000231 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  34.26 
 
 
375 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  31.02 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  31.02 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.42 
 
 
770 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.79 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  30.25 
 
 
294 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  33.94 
 
 
293 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.51 
 
 
311 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1874  prephenate dehydrogenase  36.04 
 
 
313 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  32.16 
 
 
292 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.93 
 
 
314 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.07 
 
 
311 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  28.42 
 
 
286 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  32.86 
 
 
292 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  33.08 
 
 
301 aa  136  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  30.96 
 
 
294 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 
292 aa  136  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5818  Prephenate dehydrogenase  34.87 
 
 
309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.74 
 
 
780 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  30.96 
 
 
294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  35.82 
 
 
370 aa  135  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1540  Prephenate dehydrogenase  34.3 
 
 
285 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3263  cyclohexadienyl dehydrogenase  36 
 
 
298 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  34.04 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3283  prephenate dehydrogenase  32.84 
 
 
298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0269718  normal  0.62503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  33.91 
 
 
330 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.07 
 
 
311 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  36.76 
 
 
312 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  28.78 
 
 
365 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 
362 aa  132  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  35.06 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>