More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0216 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0143  prephenate dehydrogenase  63.64 
 
 		 275 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0125  prephenate dehydrogenase  64.36 
 
 		 275 aa  332  4e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0165  prephenate dehydrogenase  64.36 
 
 		 275 aa  332  4e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000395758  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  59.14 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  59.14 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  52.9 
 
 		 276 aa  288  9e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  53.82 
 
 		 275 aa  279  4e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  50.58 
 
 		 276 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  47.64 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  36.69 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  37.63 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6542  Prephenate dehydrogenase  35.48 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  36.64 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3793  prephenate dehydrogenase  34.17 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  36.1 
 
 		 279 aa  169  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  34.39 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  32.49 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.73 
 
 		 742 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3737  Prephenate dehydrogenase  31.32 
 
 		 356 aa  158  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.39 
 
 		 311 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  28.21 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  32.96 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  34.3 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  32.74 
 
 		 367 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  29.24 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.67 
 
 		 313 aa  151  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  29.82 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  28.73 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.75 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  29.29 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  30.88 
 
 		 286 aa  148  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  35.71 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  29.96 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  33.57 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  28.93 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  29.23 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  29.6 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  33.84 
 
 		 288 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4722  prephenate dehydrogenase  30.32 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  31.58 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  28.21 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  32.14 
 
 		 289 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.39 
 
 		 770 aa  143  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 		 302 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 		 328 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.67 
 
 		 311 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  31.5 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.21 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.36 
 
 		 735 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.11 
 
 		 748 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6215  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.6 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.951807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0960  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.6 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0394985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.73 
 
 		 746 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  32.97 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  34.66 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  31.05 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  31.05 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  26.35 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 		 299 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  29.45 
 
 		 534 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  31.14 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.25 
 
 		 746 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.84 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 367 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  30.07 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 		 378 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.57 
 
 		 301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  28.08 
 
 		 301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  29.04 
 
 		 370 aa  136  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  28.83 
 
 		 366 aa  135  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.66 
 
 		 314 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.54 
 
 		 745 aa  135  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  30.04 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  29.09 
 
 		 535 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  29.58 
 
 		 366 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.92 
 
 		 780 aa  133  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.96 
 
 		 312 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.47 
 
 		 311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  27.34 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.16 
 
 		 310 aa  132  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 		 378 aa  131  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.34 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.96 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.72 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>