126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0890 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 253 aa  508  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  69.6 
 
 		 250 aa  362  4e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0799  prephenate dehydrogenase  69.72 
 
 		 250 aa  361  6e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.759284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2024  prephenate dehydrogenase  69.08 
 
 		 250 aa  351  7e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  33.51 
 
 		 505 aa  82  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  26.98 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  26.51 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  26.98 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  26.07 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  27.51 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  26.24 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  28.42 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  29.59 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  24.22 
 
 		 351 aa  67  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  29.86 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  31.82 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  25.95 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  29.03 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  28.18 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  23.94 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  23.94 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  25.64 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  25.64 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  27.14 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  28.24 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  27.69 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  26.63 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  24.62 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  29.48 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  26.48 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  26.25 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  27.68 
 
 		 293 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  22.45 
 
 		 276 aa  52.8  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  26.89 
 
 		 346 aa  52.4  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3007  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.16 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.42 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  28.9 
 
 		 373 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  29.49 
 
 		 274 aa  52.4  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  25 
 
 		 745 aa  52  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.44 
 
 		 310 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  26.67 
 
 		 294 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  24.26 
 
 		 301 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  24.24 
 
 		 447 aa  50.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  26.99 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.82 
 
 		 374 aa  50.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  24.11 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  22.08 
 
 		 276 aa  50.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  28 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  27.62 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  24.05 
 
 		 748 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  26.27 
 
 		 294 aa  49.3  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  24.84 
 
 		 371 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  26.43 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0273  Prephenate dehydrogenase  25.56 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.974204  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  25.89 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  26.01 
 
 		 375 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.43 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.86 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  25.1 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  26.19 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.56 
 
 		 308 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  25.75 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  29.13 
 
 		 706 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  21.78 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  24.47 
 
 		 534 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.15 
 
 		 746 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  25.75 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  24.89 
 
 		 735 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.37 
 
 		 746 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2357  Prephenate dehydrogenase  25.75 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  23.56 
 
 		 320 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  26.37 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  25 
 
 		 750 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  25.77 
 
 		 322 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.86 
 
 		 311 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  21.36 
 
 		 319 aa  45.4  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119548  arogenate dehydrogenase, putative  21.94 
 
 		 321 aa  45.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  22.89 
 
 		 333 aa  45.4  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  28.14 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  24.84 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.7 
 
 		 742 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  24.86 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  25.6 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  25.6 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.6 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  23.88 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.24 
 
 		 746 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.6 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.6 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.24 
 
 		 746 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.6 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.6 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  23.77 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  23.85 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.6 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>