95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2024 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2024  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  72.98 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0799  prephenate dehydrogenase  72.18 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.759284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  69.08 
 
 		 253 aa  351  7e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  28.44 
 
 		 287 aa  79  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  28.44 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  27.65 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  31.41 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  25.93 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  27.27 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  27.09 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  29.07 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  26.18 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  25.57 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  30.23 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  27 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  26.02 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  30.23 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  28.37 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  27.34 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  27.96 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  27.21 
 
 		 439 aa  55.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.65 
 
 		 373 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  31.21 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  25.76 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  26.47 
 
 		 443 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.65 
 
 		 373 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  27.21 
 
 		 443 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  26.67 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  27.07 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.65 
 
 		 373 aa  53.1  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  33.83 
 
 		 288 aa  53.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  25.54 
 
 		 279 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  25.76 
 
 		 439 aa  52.8  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.07 
 
 		 373 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.07 
 
 		 373 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  24.04 
 
 		 254 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.67 
 
 		 374 aa  50.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.11 
 
 		 311 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.81 
 
 		 373 aa  49.3  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.79 
 
 		 379 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.92 
 
 		 313 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  23.47 
 
 		 290 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.51 
 
 		 372 aa  48.5  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.08 
 
 		 746 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  28.65 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  24.83 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  24.44 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  25.44 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.56 
 
 		 373 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  23.91 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  26.14 
 
 		 371 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1358  Prephenate dehydrogenase  24.69 
 
 		 290 aa  46.2  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  23.32 
 
 		 284 aa  46.2  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  24.46 
 
 		 313 aa  45.8  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  27.53 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.75 
 
 		 379 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 339 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  27.91 
 
 		 297 aa  45.4  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  25.76 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.04 
 
 		 384 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.04 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.09 
 
 		 373 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.09 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.46 
 
 		 735 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1485  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.92 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.478793  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.09 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.58 
 
 		 314 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119548  arogenate dehydrogenase, putative  21.76 
 
 		 321 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  23.58 
 
 		 534 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  24.54 
 
 		 375 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  20.93 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  25.38 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.14 
 
 		 375 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  25 
 
 		 313 aa  42.7  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  22.67 
 
 		 301 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  20.81 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.62 
 
 		 379 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.01 
 
 		 383 aa  42.4  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  24.87 
 
 		 746 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.22 
 
 		 379 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.22 
 
 		 379 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.99 
 
 		 375 aa  42  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  25.22 
 
 		 288 aa  42  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>