92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0799 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0799  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 250 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.759284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  87.15 
 
 		 250 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2024  prephenate dehydrogenase  72.18 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  69.72 
 
 		 253 aa  361  6e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  28.33 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  27.98 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  33.51 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  28.44 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  27.21 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  27.81 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  24.35 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  32.24 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  28.22 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  26.09 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  28.34 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  25.54 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  27.41 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  27.44 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  28.4 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  30.15 
 
 		 439 aa  57  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  33.08 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  25.36 
 
 		 288 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  29 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  27.35 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  27.66 
 
 		 443 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  26.63 
 
 		 447 aa  52.4  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  26.95 
 
 		 443 aa  52.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.28 
 
 		 374 aa  51.6  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  28.28 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.35 
 
 		 735 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  32.43 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  25.59 
 
 		 375 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  25.69 
 
 		 439 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0515  prephenate dehydrogenase  25.47 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  23.38 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  30.37 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  27.43 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  28.8 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  26.84 
 
 		 534 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.68 
 
 		 373 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.68 
 
 		 373 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.68 
 
 		 373 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.85 
 
 		 375 aa  48.9  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  27.95 
 
 		 535 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  30.46 
 
 		 373 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  29.89 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  26.84 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  25.82 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.372854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.39 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.21 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  25.59 
 
 		 346 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.11 
 
 		 373 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.29 
 
 		 321 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  27.36 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  22.29 
 
 		 276 aa  47  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.32 
 
 		 750 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.86 
 
 		 321 aa  46.2  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.12 
 
 		 746 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  27.86 
 
 		 267 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1431  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.26 
 
 		 297 aa  45.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  29.75 
 
 		 371 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  38.53 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.44 
 
 		 311 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.17 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.17 
 
 		 373 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  24.32 
 
 		 770 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.92 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.17 
 
 		 373 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  26.32 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 		 373 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.17 
 
 		 746 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  22.61 
 
 		 319 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  37.07 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.53 
 
 		 375 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  24.74 
 
 		 301 aa  43.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  26.26 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.55 
 
 		 384 aa  42.4  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.19 
 
 		 746 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.58 
 
 		 377 aa  42.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  24.23 
 
 		 320 aa  42.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  20.11 
 
 		 275 aa  42  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.55 
 
 		 313 aa  42  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0241407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>