299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0227 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  100 
 
 
375 aa  772    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  84.8 
 
 
375 aa  667    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  84 
 
 
375 aa  658    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  72.46 
 
 
377 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  66.85 
 
 
373 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  67.03 
 
 
373 aa  522  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  66.76 
 
 
373 aa  520  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.95 
 
 
373 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.95 
 
 
373 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.95 
 
 
373 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  64.77 
 
 
375 aa  512  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  64.59 
 
 
373 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  64.59 
 
 
373 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  64.59 
 
 
373 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  64.59 
 
 
373 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  66.22 
 
 
372 aa  508  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  64.59 
 
 
373 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  64.59 
 
 
373 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  64.59 
 
 
373 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  66.49 
 
 
373 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  64.59 
 
 
373 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  64.32 
 
 
373 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  63.07 
 
 
373 aa  504  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  63.07 
 
 
373 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  63.07 
 
 
373 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  63.07 
 
 
373 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  63.07 
 
 
373 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  62.53 
 
 
373 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  61.96 
 
 
379 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.19 
 
 
379 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.51 
 
 
379 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.38 
 
 
383 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.97 
 
 
379 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.65 
 
 
383 aa  442  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.38 
 
 
379 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.38 
 
 
383 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  55.59 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.11 
 
 
379 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.11 
 
 
379 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.38 
 
 
379 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.11 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.15 
 
 
384 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  54.59 
 
 
375 aa  432  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.52 
 
 
384 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.77 
 
 
383 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  54.05 
 
 
384 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.34 
 
 
384 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.86 
 
 
381 aa  405  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  44.03 
 
 
706 aa  223  4.9999999999999996e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  33.43 
 
 
371 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  36.72 
 
 
288 aa  177  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  35.58 
 
 
274 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  34.94 
 
 
283 aa  169  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  35.55 
 
 
276 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  32.5 
 
 
505 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  32.95 
 
 
274 aa  145  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  30.74 
 
 
447 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  30.34 
 
 
279 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  29.43 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  29.71 
 
 
443 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  29.33 
 
 
437 aa  133  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  29.71 
 
 
443 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 
439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  30.21 
 
 
288 aa  119  7e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  26.1 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  32.46 
 
 
242 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  31.6 
 
 
373 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  31.6 
 
 
373 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  33.1 
 
 
375 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  30.74 
 
 
374 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  22.19 
 
 
351 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  25.52 
 
 
294 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  27.84 
 
 
258 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  29.57 
 
 
259 aa  94.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  27.84 
 
 
262 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  27.34 
 
 
288 aa  89  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  25.99 
 
 
346 aa  87.4  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  26.32 
 
 
263 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  25.35 
 
 
287 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  27.2 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  25.18 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  24.24 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  24.71 
 
 
260 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  23.89 
 
 
283 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  26.58 
 
 
332 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  43.01 
 
 
397 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  24.47 
 
 
276 aa  62.8  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  25.29 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2392  Prephenate dehydrogenase  24.89 
 
 
287 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.801901  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  27.12 
 
 
258 aa  60.5  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  40 
 
 
107 aa  60.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  27.12 
 
 
258 aa  59.3  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  21.84 
 
 
276 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  39.44 
 
 
359 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  21.05 
 
 
275 aa  57  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  20.98 
 
 
276 aa  57  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  25 
 
 
384 aa  56.6  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.83 
 
 
358 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  36.17 
 
 
366 aa  56.2  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0106  Prephenate dehydrogenase  24.68 
 
 
290 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>