79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1368 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 332 aa  650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  35.87 
 
 		 294 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  25.29 
 
 		 505 aa  89.4  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  27.41 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.07 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  25.51 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.51 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.24 
 
 		 373 aa  76.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.56 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  32.58 
 
 		 706 aa  75.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.11 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.38 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.11 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.11 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.11 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.21 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  31.77 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  32.47 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.47 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.31 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.33 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.51 
 
 		 375 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.85 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.96 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  27.96 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.39 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.99 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.65 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.73 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.45 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  32.99 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.5 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.67 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.67 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.45 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  27.83 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.29 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  24.23 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.16 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  23.71 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.24 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  29.75 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.72 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.72 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.76 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.76 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  31.06 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.6 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.76 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  22.54 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  22.15 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  21.12 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  24.5 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  21.5 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  26.59 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  19.42 
 
 		 447 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1424  Prephenate dehydrogenase  30 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  24.14 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2357  Prephenate dehydrogenase  34.59 
 
 		 243 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  30.13 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  24.63 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2392  Prephenate dehydrogenase  36.36 
 
 		 287 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.801901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  31.65 
 
 		 375 aa  46.2  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  20.62 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52223  prephenate dehydrogenase  26.54 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  32.32 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  28.41 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  28.41 
 
 		 373 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>