31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52223 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_52223  prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 449 aa  934    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05959  prephenate dehydrogenase (Eurofung)  58.93 
 
 		 437 aa  530  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.554937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03330  prephenate dehydrogenase, putative  48.64 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211762  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  25.41 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  23.46 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  22.18 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  20.73 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  20.45 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  23.3 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  23.83 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  21.4 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  24.62 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  19.15 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119548  arogenate dehydrogenase, putative  24.36 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  23.27 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  24.41 
 
 		 258 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  21.15 
 
 		 274 aa  54.3  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  22.62 
 
 		 288 aa  53.5  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  26.24 
 
 		 237 aa  53.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  25.95 
 
 		 294 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  25.13 
 
 		 317 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  25.26 
 
 		 283 aa  48.5  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  24.77 
 
 		 279 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4985  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.42 
 
 		 289 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  24.49 
 
 		 258 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  20.92 
 
 		 276 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  23.08 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  25.14 
 
 		 281 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  23.41 
 
 		 258 aa  44.7  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  22.34 
 
 		 266 aa  43.5  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1784  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  47.06 
 
 		 608 aa  43.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>