96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119548 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119548  arogenate dehydrogenase, putative  100 
 
 		 321 aa  665    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43288  prephenate dehydrogenase  36.9 
 
 		 395 aa  176  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  28.28 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  28.16 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  27.42 
 
 		 258 aa  99.4  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  27.42 
 
 		 266 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  27.42 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  26.72 
 
 		 281 aa  90.1  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  28.51 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1369  Prephenate dehydrogenase  29.11 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  28.7 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  29.53 
 
 		 505 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  26.73 
 
 		 437 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  26.89 
 
 		 317 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  23.55 
 
 		 447 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  26.18 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  23.33 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  22.92 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  23.33 
 
 		 443 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  24.22 
 
 		 439 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  28.33 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03330  prephenate dehydrogenase, putative  23.6 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211762  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  25.78 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  26.07 
 
 		 364 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52223  prephenate dehydrogenase  24.36 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  31.69 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.64 
 
 		 373 aa  57  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1209  Arogenate dehydrogenase  25.26 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0362078 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  25.21 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  25.21 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.21 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.21 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  25.21 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.21 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.21 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.21 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.21 
 
 		 373 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.9 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.9 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.37 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  28.81 
 
 		 287 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.9 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.9 
 
 		 373 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  31.75 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.58 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.43 
 
 		 383 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  23.26 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.75 
 
 		 384 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.06 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.55 
 
 		 373 aa  50.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.46 
 
 		 377 aa  50.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.47 
 
 		 373 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.47 
 
 		 373 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  23.02 
 
 		 283 aa  49.3  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  25.1 
 
 		 288 aa  49.3  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.14 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.08 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.45 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05959  prephenate dehydrogenase (Eurofung)  22.63 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.554937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.57 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  26.62 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  23.32 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.32 
 
 		 375 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  22.61 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  22.87 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  21.94 
 
 		 374 aa  47.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.65 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  26.04 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  26.55 
 
 		 706 aa  46.6  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.05 
 
 		 381 aa  46.2  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  22.69 
 
 		 258 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  22.87 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  37.1 
 
 		 367 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.66 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  21.94 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  24.1 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  27.39 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  24.5 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.27 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.11 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  24.77 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.75 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2408  Prephenate dehydrogenase  24.56 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25 
 
 		 384 aa  43.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.14 
 
 		 375 aa  43.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0659  prephenate dehydrogenase  21.94 
 
 		 276 aa  43.1  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.773166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.58 
 
 		 379 aa  43.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2024  prephenate dehydrogenase  21.76 
 
 		 250 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  25.79 
 
 		 364 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  25.81 
 
 		 292 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  22.73 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2807  Prephenate dehydrogenase  26.09 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  29.7 
 
 		 218 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.03 
 
 		 379 aa  42.4  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>