279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3147 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  86.86 
 
 		 373 aa  674    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  86.6 
 
 		 373 aa  672    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  85.25 
 
 		 373 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.86 
 
 		 373 aa  674    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.6 
 
 		 373 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.56 
 
 		 373 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.29 
 
 		 373 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.02 
 
 		 373 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.86 
 
 		 373 aa  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.33 
 
 		 373 aa  676    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  87.67 
 
 		 373 aa  663    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  83.91 
 
 		 373 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  86.86 
 
 		 373 aa  674    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.56 
 
 		 373 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  98.66 
 
 		 373 aa  754    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.86 
 
 		 373 aa  674    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 373 aa  764    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  84.99 
 
 		 373 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  85.25 
 
 		 373 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.86 
 
 		 373 aa  674    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.86 
 
 		 373 aa  674    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.56 
 
 		 373 aa  670    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  88.98 
 
 		 372 aa  662    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  66.49 
 
 		 375 aa  529  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  66.49 
 
 		 375 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  66.76 
 
 		 375 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.95 
 
 		 377 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  61.79 
 
 		 375 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.41 
 
 		 383 aa  457  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.14 
 
 		 379 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.14 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.87 
 
 		 383 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.14 
 
 		 383 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.8 
 
 		 379 aa  448  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.91 
 
 		 374 aa  451  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.87 
 
 		 379 aa  449  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.8 
 
 		 379 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 		 379 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.26 
 
 		 379 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.26 
 
 		 379 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.99 
 
 		 384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.99 
 
 		 379 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.03 
 
 		 384 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  53.49 
 
 		 375 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  55.65 
 
 		 383 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.89 
 
 		 381 aa  408  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.72 
 
 		 384 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.3 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  43.43 
 
 		 706 aa  224  1e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  33.9 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  33.21 
 
 		 276 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  35.4 
 
 		 283 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  30.74 
 
 		 274 aa  135  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  30.74 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  33.58 
 
 		 274 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  29.72 
 
 		 505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  30.29 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  29.09 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  29.93 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  30.07 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  30.07 
 
 		 443 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 		 443 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  33.19 
 
 		 242 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  29.74 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  29.66 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  29.56 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  22.69 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  30.58 
 
 		 258 aa  94  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  29.73 
 
 		 259 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 288 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  26.75 
 
 		 262 aa  88.2  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  29.07 
 
 		 292 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  28.29 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  24.38 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  26.02 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  25.83 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  25.83 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  25.93 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  30.29 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  24.72 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  28.18 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  32.99 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  27.11 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  21.98 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  27.43 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  58.33 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  56 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  34.13 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  43.9 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  42.31 
 
 		 110 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  38.46 
 
 		 96 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  41.03 
 
 		 115 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0652  chorismate mutase  41.03 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0670145  normal  0.113986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0663  chorismate mutase  41.03 
 
 		 115 aa  57  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  22.9 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  30.38 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  24.9 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  30.85 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 		 237 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  30.19 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>