255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1877 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  100 
 
 
344 aa  695    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  49.85 
 
 
346 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0808  chorismate mutase  34.12 
 
 
333 aa  169  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0594729  normal  0.450237 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.52 
 
 
375 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.76 
 
 
379 aa  92.8  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  29.9 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.61 
 
 
375 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.9 
 
 
373 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  29.9 
 
 
373 aa  90.5  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.37 
 
 
373 aa  89.7  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.21 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.21 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 
373 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.24 
 
 
374 aa  86.7  6e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.96 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.87 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.89 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  25.77 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.26 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  27.59 
 
 
439 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.24 
 
 
384 aa  82  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.62 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.67 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.67 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.39 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.39 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.39 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  27.16 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  27.59 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.15 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.46 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.46 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.46 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.46 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.53 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.05 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.18 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.49 
 
 
373 aa  75.9  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.49 
 
 
373 aa  75.9  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  24.93 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.91 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.09 
 
 
375 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  27.2 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.67 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.9 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  23.64 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.76 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.91 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  23.35 
 
 
439 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  26.29 
 
 
259 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.97 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  27.63 
 
 
266 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  28.35 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  24.56 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  23.53 
 
 
505 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1235  prephenate dehydrogenase  27.27 
 
 
371 aa  60.8  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.934914 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  27.49 
 
 
263 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  25 
 
 
321 aa  60.1  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.57 
 
 
321 aa  59.7  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  23.13 
 
 
371 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  25 
 
 
312 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  20.7 
 
 
742 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.24 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.91 
 
 
384 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  28.11 
 
 
237 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  23.08 
 
 
276 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1616  Prephenate dehydrogenase  24.78 
 
 
293 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  25 
 
 
313 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  28.23 
 
 
288 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  27.24 
 
 
266 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.61 
 
 
314 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.02 
 
 
358 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  24.86 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  22.75 
 
 
313 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  24.89 
 
 
301 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.02 
 
 
358 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  24.89 
 
 
291 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0440  prephenate dehydrogenase  24.35 
 
 
301 aa  57.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  26.09 
 
 
332 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  23.61 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  23.81 
 
 
286 aa  57  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  24.18 
 
 
288 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  22.65 
 
 
378 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  23.04 
 
 
366 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  28.03 
 
 
258 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  22.67 
 
 
286 aa  56.2  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  24.12 
 
 
437 aa  56.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  22.61 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  23.14 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  24.31 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  22.61 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  22.61 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  50.94 
 
 
103 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>