257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1259 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  91.56 
 
 
379 aa  721    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  100 
 
 
383 aa  791    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  83.11 
 
 
379 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  92.61 
 
 
379 aa  734    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  92.61 
 
 
379 aa  734    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  92.08 
 
 
379 aa  731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  83.11 
 
 
379 aa  659    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  99.74 
 
 
379 aa  780    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  81.63 
 
 
384 aa  654    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  99.74 
 
 
383 aa  788    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  81.27 
 
 
384 aa  643    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  98.69 
 
 
383 aa  783    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  96.87 
 
 
383 aa  770    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  80.1 
 
 
383 aa  625  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  76.98 
 
 
379 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  75.33 
 
 
384 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.41 
 
 
373 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.14 
 
 
373 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  59.14 
 
 
373 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.87 
 
 
373 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.87 
 
 
373 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.87 
 
 
373 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  58.33 
 
 
373 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  58.33 
 
 
373 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.84 
 
 
375 aa  441  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.33 
 
 
373 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.33 
 
 
373 aa  442  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.33 
 
 
373 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.33 
 
 
373 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.6 
 
 
373 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  57.84 
 
 
375 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.33 
 
 
373 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  58.33 
 
 
373 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.8 
 
 
373 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 
373 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 
373 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 
373 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.38 
 
 
375 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.26 
 
 
373 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.33 
 
 
373 aa  434  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 
373 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 
372 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  55.28 
 
 
375 aa  424  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.22 
 
 
377 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.62 
 
 
374 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  51.08 
 
 
375 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  49.19 
 
 
381 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  50.27 
 
 
384 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  40.34 
 
 
706 aa  196  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  37.05 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  35.07 
 
 
283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  33.99 
 
 
274 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  32.45 
 
 
274 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  32.44 
 
 
288 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  34.18 
 
 
242 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  31.78 
 
 
276 aa  137  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  28.72 
 
 
437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  29.93 
 
 
447 aa  134  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  27.36 
 
 
505 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  31.39 
 
 
443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  32.75 
 
 
288 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  30.55 
 
 
439 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  30.66 
 
 
443 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  28.41 
 
 
439 aa  122  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  28.63 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  29.15 
 
 
292 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  28.21 
 
 
375 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  22.35 
 
 
351 aa  94.7  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  26.09 
 
 
258 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  28.29 
 
 
263 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  25.69 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  23.91 
 
 
294 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  24.65 
 
 
288 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  31.01 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  30.62 
 
 
373 aa  87  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  31.7 
 
 
374 aa  86.3  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  33.18 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  26.05 
 
 
259 aa  84  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  24.38 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  26.17 
 
 
260 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  26.17 
 
 
346 aa  75.5  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  22.61 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  22.54 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  25.27 
 
 
344 aa  65.5  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2392  Prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 
287 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.801901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  29.76 
 
 
332 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0273  Prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 
252 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.974204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  44.83 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 
245 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  29.21 
 
 
258 aa  60.1  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6846  chorismate mutase  42.86 
 
 
397 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  29 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  28.65 
 
 
258 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2357  Prephenate dehydrogenase  29.34 
 
 
243 aa  56.6  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350726  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3393  Prephenate dehydrogenase  22.96 
 
 
303 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  23.99 
 
 
290 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  35.96 
 
 
107 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  25.48 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  38.03 
 
 
359 aa  54.3  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  38.46 
 
 
359 aa  53.9  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>