84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0273 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0273  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.974204  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2357  Prephenate dehydrogenase  61.89 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2392  Prephenate dehydrogenase  50 
 
 		 287 aa  218  7.999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.801901  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1779  prephenate dehydrogenase  51.81 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.116318 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1424  Prephenate dehydrogenase  51.84 
 
 		 278 aa  201  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  28.69 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  28.82 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  27.44 
 
 		 505 aa  76.6  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  23.79 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  24.91 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  23.35 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  21.85 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  24.58 
 
 		 439 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  24.23 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 383 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  24.06 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  24.65 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.44 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.44 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.95 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.44 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.34 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.34 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.94 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  30.87 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.8 
 
 		 379 aa  62  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  27.19 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  24.56 
 
 		 294 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  30.43 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.17 
 
 		 384 aa  58.5  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.96 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.16 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  25.48 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  27.07 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.69 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  30.45 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  28.09 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  23.69 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.34 
 
 		 375 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 373 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  27.93 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  27.93 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  27.93 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  26.63 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.48 
 
 		 373 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.73 
 
 		 384 aa  53.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.03 
 
 		 373 aa  52.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.25 
 
 		 373 aa  52.8  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.48 
 
 		 373 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.48 
 
 		 373 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.48 
 
 		 373 aa  52  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  23.69 
 
 		 377 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.79 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.58 
 
 		 373 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.58 
 
 		 373 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  29.61 
 
 		 373 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.19 
 
 		 383 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 		 373 aa  49.3  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.79 
 
 		 373 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  30.56 
 
 		 237 aa  48.9  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  28.23 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  25.56 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.18 
 
 		 375 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.88 
 
 		 373 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.88 
 
 		 373 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  29.13 
 
 		 375 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.22 
 
 		 379 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.06 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  27.87 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  27.97 
 
 		 374 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.12 
 
 		 381 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  23.21 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  28.81 
 
 		 332 aa  42.7  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  22.01 
 
 		 375 aa  42  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>