162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2811 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
259 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  49.21 
 
 
258 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  50.19 
 
 
263 aa  235  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  48.8 
 
 
262 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  47.45 
 
 
260 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  45.78 
 
 
292 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.32 
 
 
374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  32.64 
 
 
274 aa  102  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.57 
 
 
375 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  29.78 
 
 
375 aa  99  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.73 
 
 
377 aa  98.2  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.54 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.28 
 
 
373 aa  97.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.43 
 
 
372 aa  96.3  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.18 
 
 
373 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.38 
 
 
379 aa  95.9  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.28 
 
 
373 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.28 
 
 
373 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.13 
 
 
375 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.57 
 
 
375 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.69 
 
 
373 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 
373 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.15 
 
 
373 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 
373 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 
373 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.29 
 
 
373 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.41 
 
 
373 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.27 
 
 
373 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  29.27 
 
 
373 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.27 
 
 
373 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.73 
 
 
373 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  29.27 
 
 
373 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.27 
 
 
373 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.27 
 
 
373 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.27 
 
 
373 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  29.27 
 
 
373 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
379 aa  92  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.99 
 
 
373 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.77 
 
 
379 aa  91.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.77 
 
 
384 aa  91.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  32.2 
 
 
371 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.5 
 
 
384 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.44 
 
 
383 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.92 
 
 
379 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.92 
 
 
379 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.92 
 
 
379 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  26.21 
 
 
437 aa  88.6  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  32.27 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.67 
 
 
384 aa  87.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.78 
 
 
379 aa  86.3  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  30.6 
 
 
281 aa  85.1  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  32.58 
 
 
266 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  32.58 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  25.21 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.05 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.05 
 
 
379 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.05 
 
 
383 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  32.95 
 
 
317 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  31.98 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.62 
 
 
383 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.63 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.7 
 
 
384 aa  82.4  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.55 
 
 
375 aa  82  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  27.08 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  29.88 
 
 
706 aa  80.5  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  29.25 
 
 
276 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.52 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  26.67 
 
 
443 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  26.11 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1369  Prephenate dehydrogenase  35.23 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  31.35 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  26.11 
 
 
443 aa  73.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  25.94 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  24.73 
 
 
447 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  28.44 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  28.09 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2114  prephenate dehydrogenase  29.33 
 
 
285 aa  65.5  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  27.23 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  26.74 
 
 
439 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  25.35 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  25.56 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  27.07 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 
287 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  30.08 
 
 
344 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.33 
 
 
313 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.46 
 
 
314 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1647  Prephenate dehydrogenase  29.04 
 
 
312 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.59901  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  26.76 
 
 
291 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  22.47 
 
 
351 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.38 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  30.99 
 
 
375 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.17 
 
 
313 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  26.92 
 
 
288 aa  56.2  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  26.8 
 
 
364 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  29.46 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  32.67 
 
 
290 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  29.33 
 
 
314 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>