131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1063 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1063  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
258 aa  540  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0955  prephenate dehydrogenase  98.45 
 
 
258 aa  532  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  33.6 
 
 
254 aa  139  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 
281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4379  Prephenate dehydrogenase  29.76 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0691262  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  36.16 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4010  prephenate dehydrogenase  30.12 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.246742  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4492  Prephenate dehydrogenase  29.43 
 
 
267 aa  115  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.192992  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119548  arogenate dehydrogenase, putative  28.28 
 
 
321 aa  101  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  26.25 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1369  Prephenate dehydrogenase  29.44 
 
 
257 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  26.55 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  25.13 
 
 
443 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  28.81 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  28.65 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  28.25 
 
 
287 aa  72  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  27.68 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43288  prephenate dehydrogenase  22.14 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  22.45 
 
 
439 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  24.87 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  24.42 
 
 
443 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  24.7 
 
 
505 aa  67.8  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  26.11 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  24.68 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  25.11 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  22.95 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  22.96 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  25.81 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  27.06 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.55 
 
 
377 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  22.65 
 
 
439 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.12 
 
 
375 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  26.55 
 
 
375 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.55 
 
 
379 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.34 
 
 
383 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0890  prephenate dehydrogenase  23.94 
 
 
253 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  26.26 
 
 
274 aa  62.4  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.12 
 
 
374 aa  62.4  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1785  prephenate dehydrogenase  24.86 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.12 
 
 
379 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  28.1 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.21 
 
 
379 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.12 
 
 
375 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.42 
 
 
311 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.4 
 
 
384 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03330  prephenate dehydrogenase, putative  24 
 
 
446 aa  60.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211762  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.65 
 
 
379 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.65 
 
 
379 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.21 
 
 
383 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28 
 
 
373 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28 
 
 
373 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.21 
 
 
379 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.21 
 
 
383 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  29.21 
 
 
383 aa  59.3  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2024  prephenate dehydrogenase  25.57 
 
 
250 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05959  prephenate dehydrogenase (Eurofung)  24.81 
 
 
437 aa  58.9  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.554937  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  30.46 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0799  prephenate dehydrogenase  26.09 
 
 
250 aa  58.9  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.759284  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.65 
 
 
379 aa  58.9  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  26.1 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.55 
 
 
373 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.42 
 
 
373 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  26.61 
 
 
314 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  23.86 
 
 
262 aa  55.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.57 
 
 
373 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.57 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.57 
 
 
373 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.57 
 
 
373 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.57 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.4 
 
 
384 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  26.44 
 
 
373 aa  53.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  22.94 
 
 
374 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  25.86 
 
 
373 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.86 
 
 
373 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  24.3 
 
 
750 aa  53.1  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  21.93 
 
 
313 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.86 
 
 
373 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.86 
 
 
373 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.86 
 
 
373 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.86 
 
 
373 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  25.86 
 
 
373 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.86 
 
 
373 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  25.86 
 
 
373 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.14 
 
 
373 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.86 
 
 
372 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  25.14 
 
 
373 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.05 
 
 
313 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1035  cyclohexadienyl dehydrogenase  23.5 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.514504  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  27.88 
 
 
384 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  21.55 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  24.86 
 
 
379 aa  50.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  26.77 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  21.24 
 
 
287 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  25.43 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  21.32 
 
 
279 aa  49.7  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  25.47 
 
 
311 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  23 
 
 
310 aa  48.9  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.83 
 
 
375 aa  48.9  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  22.18 
 
 
314 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>